Protein–RNA interactions for Protein: Q6NSW3

Sphkap, A-kinase anchor protein SPHKAP, mousemouse

Predictions only

Length 1,687 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SphkapQ6NSW3 Gm25548-201ENSMUST00000178681 110 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
SphkapQ6NSW3 Gm23147-201ENSMUST00000178841 110 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
SphkapQ6NSW3 Gm26095-201ENSMUST00000179270 110 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
SphkapQ6NSW3 Gm22171-201ENSMUST00000179283 110 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
SphkapQ6NSW3 Gm23936-201ENSMUST00000179354 110 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
SphkapQ6NSW3 Gm22619-201ENSMUST00000179516 110 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
SphkapQ6NSW3 Gm25255-201ENSMUST00000179579 110 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
SphkapQ6NSW3 Gm24755-201ENSMUST00000179691 110 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
SphkapQ6NSW3 Gm26506-201ENSMUST00000179692 110 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
SphkapQ6NSW3 Gm10142-201ENSMUST00000179767 363 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SphkapQ6NSW3 Gm25086-201ENSMUST00000179931 110 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
SphkapQ6NSW3 Gm23243-201ENSMUST00000180047 110 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
SphkapQ6NSW3 Gm24659-201ENSMUST00000180212 110 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
SphkapQ6NSW3 Gm24169-201ENSMUST00000180244 110 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
SphkapQ6NSW3 Gm23689-201ENSMUST00000180354 110 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
SphkapQ6NSW3 Gm27359-201ENSMUST00000184153 110 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
SphkapQ6NSW3 Gm27785-201ENSMUST00000184268 110 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
SphkapQ6NSW3 Gm27466-201ENSMUST00000184396 110 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
SphkapQ6NSW3 Gm27703-201ENSMUST00000184836 110 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
SphkapQ6NSW3 Rxfp4-201ENSMUST00000063119 1245 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SphkapQ6NSW3 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SphkapQ6NSW3 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SphkapQ6NSW3 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SphkapQ6NSW3 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SphkapQ6NSW3 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SphkapQ6NSW3 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SphkapQ6NSW3 Bet1l-209ENSMUST00000211624 769 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SphkapQ6NSW3 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SphkapQ6NSW3 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SphkapQ6NSW3 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SphkapQ6NSW3 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
SphkapQ6NSW3 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
SphkapQ6NSW3 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
SphkapQ6NSW3 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SphkapQ6NSW3 Nt5dc2-201ENSMUST00000090212 1407 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SphkapQ6NSW3 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SphkapQ6NSW3 Rab4a-201ENSMUST00000117702 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SphkapQ6NSW3 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
SphkapQ6NSW3 Gm42560-201ENSMUST00000201216 1023 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SphkapQ6NSW3 Rps15-201ENSMUST00000062674 572 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SphkapQ6NSW3 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SphkapQ6NSW3 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SphkapQ6NSW3 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SphkapQ6NSW3 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SphkapQ6NSW3 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SphkapQ6NSW3 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SphkapQ6NSW3 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SphkapQ6NSW3 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SphkapQ6NSW3 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
SphkapQ6NSW3 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SphkapQ6NSW3 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SphkapQ6NSW3 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SphkapQ6NSW3 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SphkapQ6NSW3 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
SphkapQ6NSW3 Gm12151-201ENSMUST00000121374 290 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
SphkapQ6NSW3 Gm7774-201ENSMUST00000200064 533 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
SphkapQ6NSW3 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SphkapQ6NSW3 Prrg2-207ENSMUST00000210500 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SphkapQ6NSW3 Aprt-209ENSMUST00000213062 560 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SphkapQ6NSW3 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SphkapQ6NSW3 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SphkapQ6NSW3 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SphkapQ6NSW3 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SphkapQ6NSW3 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SphkapQ6NSW3 Crym-201ENSMUST00000033198 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SphkapQ6NSW3 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SphkapQ6NSW3 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SphkapQ6NSW3 CT025626.1-201ENSMUST00000223735 1455 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
SphkapQ6NSW3 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SphkapQ6NSW3 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SphkapQ6NSW3 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SphkapQ6NSW3 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
SphkapQ6NSW3 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SphkapQ6NSW3 Tnfrsf13b-202ENSMUST00000101103 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SphkapQ6NSW3 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SphkapQ6NSW3 2410004P03Rik-203ENSMUST00000190691 953 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SphkapQ6NSW3 Mpv17-207ENSMUST00000201491 923 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SphkapQ6NSW3 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SphkapQ6NSW3 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SphkapQ6NSW3 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SphkapQ6NSW3 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SphkapQ6NSW3 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
SphkapQ6NSW3 Gm20553-201ENSMUST00000204205 844 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
SphkapQ6NSW3 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SphkapQ6NSW3 Iqcf3-201ENSMUST00000062917 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SphkapQ6NSW3 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SphkapQ6NSW3 Gm34016-201ENSMUST00000222678 1384 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SphkapQ6NSW3 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SphkapQ6NSW3 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SphkapQ6NSW3 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SphkapQ6NSW3 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SphkapQ6NSW3 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SphkapQ6NSW3 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SphkapQ6NSW3 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SphkapQ6NSW3 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SphkapQ6NSW3 Ppil3-203ENSMUST00000114348 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SphkapQ6NSW3 Gm13223-201ENSMUST00000118609 747 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
SphkapQ6NSW3 Mmab-203ENSMUST00000123256 1277 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SphkapQ6NSW3 1700060J05Rik-201ENSMUST00000138377 1060 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SphkapQ6NSW3 2410002F23Rik-214ENSMUST00000186606 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.8 ms