Protein–RNA interactions for Protein: Q6KAU4

Mvb12b, Multivesicular body subunit 12B, mousemouse

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mvb12bQ6KAU4 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Mvb12bQ6KAU4 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Mvb12bQ6KAU4 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Mvb12bQ6KAU4 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Mvb12bQ6KAU4 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Mvb12bQ6KAU4 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Mvb12bQ6KAU4 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Mvb12bQ6KAU4 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Mvb12bQ6KAU4 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Mvb12bQ6KAU4 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Mvb12bQ6KAU4 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Mvb12bQ6KAU4 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Mvb12bQ6KAU4 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Mvb12bQ6KAU4 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Mvb12bQ6KAU4 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Mvb12bQ6KAU4 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Mvb12bQ6KAU4 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Mvb12bQ6KAU4 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Mvb12bQ6KAU4 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Mvb12bQ6KAU4 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Mvb12bQ6KAU4 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Mvb12bQ6KAU4 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Mvb12bQ6KAU4 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Mvb12bQ6KAU4 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Mvb12bQ6KAU4 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Mvb12bQ6KAU4 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Mvb12bQ6KAU4 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Mvb12bQ6KAU4 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Mvb12bQ6KAU4 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Mvb12bQ6KAU4 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Mvb12bQ6KAU4 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Mvb12bQ6KAU4 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Mvb12bQ6KAU4 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Mvb12bQ6KAU4 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Mvb12bQ6KAU4 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Mvb12bQ6KAU4 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Mvb12bQ6KAU4 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Mvb12bQ6KAU4 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Mvb12bQ6KAU4 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Mvb12bQ6KAU4 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Mvb12bQ6KAU4 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Mvb12bQ6KAU4 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Mvb12bQ6KAU4 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Mvb12bQ6KAU4 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Mvb12bQ6KAU4 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Mvb12bQ6KAU4 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Mvb12bQ6KAU4 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Mvb12bQ6KAU4 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Mvb12bQ6KAU4 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Mvb12bQ6KAU4 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Mvb12bQ6KAU4 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Mvb12bQ6KAU4 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Mvb12bQ6KAU4 Gm23935-201ENSMUST00000102303 57 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Mvb12bQ6KAU4 Gm24270-201ENSMUST00000102326 57 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Mvb12bQ6KAU4 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Mvb12bQ6KAU4 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Mvb12bQ6KAU4 Gm24245-201ENSMUST00000157318 57 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Mvb12bQ6KAU4 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Mvb12bQ6KAU4 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Mvb12bQ6KAU4 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Mvb12bQ6KAU4 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Mvb12bQ6KAU4 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Mvb12bQ6KAU4 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Mvb12bQ6KAU4 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Mvb12bQ6KAU4 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Mvb12bQ6KAU4 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Mvb12bQ6KAU4 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Mvb12bQ6KAU4 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Mvb12bQ6KAU4 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Mvb12bQ6KAU4 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Mvb12bQ6KAU4 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Mvb12bQ6KAU4 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Mvb12bQ6KAU4 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Mvb12bQ6KAU4 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Mvb12bQ6KAU4 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Mvb12bQ6KAU4 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Mvb12bQ6KAU4 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Mvb12bQ6KAU4 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Mvb12bQ6KAU4 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Mvb12bQ6KAU4 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Mvb12bQ6KAU4 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Mvb12bQ6KAU4 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Mvb12bQ6KAU4 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Mvb12bQ6KAU4 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Mvb12bQ6KAU4 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Mvb12bQ6KAU4 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Mvb12bQ6KAU4 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Mvb12bQ6KAU4 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Mvb12bQ6KAU4 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Mvb12bQ6KAU4 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Mvb12bQ6KAU4 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Mvb12bQ6KAU4 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Mvb12bQ6KAU4 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Mvb12bQ6KAU4 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Mvb12bQ6KAU4 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Mvb12bQ6KAU4 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Mvb12bQ6KAU4 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Mvb12bQ6KAU4 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Mvb12bQ6KAU4 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Mvb12bQ6KAU4 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.3 ms