Protein–RNA interactions for Protein: Q6IRT3

Parpbp, PCNA-interacting partner, mousemouse

Predictions only

Length 573 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ParpbpQ6IRT3 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
ParpbpQ6IRT3 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
ParpbpQ6IRT3 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
ParpbpQ6IRT3 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
ParpbpQ6IRT3 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
ParpbpQ6IRT3 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
ParpbpQ6IRT3 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
ParpbpQ6IRT3 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
ParpbpQ6IRT3 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
ParpbpQ6IRT3 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
ParpbpQ6IRT3 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
ParpbpQ6IRT3 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
ParpbpQ6IRT3 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
ParpbpQ6IRT3 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
ParpbpQ6IRT3 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
ParpbpQ6IRT3 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
ParpbpQ6IRT3 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
ParpbpQ6IRT3 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
ParpbpQ6IRT3 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
ParpbpQ6IRT3 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
ParpbpQ6IRT3 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
ParpbpQ6IRT3 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
ParpbpQ6IRT3 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
ParpbpQ6IRT3 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
ParpbpQ6IRT3 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
ParpbpQ6IRT3 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC14.86□□□□□ -0.03
ParpbpQ6IRT3 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
ParpbpQ6IRT3 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
ParpbpQ6IRT3 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
ParpbpQ6IRT3 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
ParpbpQ6IRT3 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
ParpbpQ6IRT3 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
ParpbpQ6IRT3 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
ParpbpQ6IRT3 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
ParpbpQ6IRT3 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
ParpbpQ6IRT3 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
ParpbpQ6IRT3 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
ParpbpQ6IRT3 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
ParpbpQ6IRT3 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
ParpbpQ6IRT3 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
ParpbpQ6IRT3 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
ParpbpQ6IRT3 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
ParpbpQ6IRT3 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
ParpbpQ6IRT3 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
ParpbpQ6IRT3 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
ParpbpQ6IRT3 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
ParpbpQ6IRT3 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
ParpbpQ6IRT3 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
ParpbpQ6IRT3 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
ParpbpQ6IRT3 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
ParpbpQ6IRT3 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
ParpbpQ6IRT3 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
ParpbpQ6IRT3 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
ParpbpQ6IRT3 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
ParpbpQ6IRT3 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
ParpbpQ6IRT3 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
ParpbpQ6IRT3 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
ParpbpQ6IRT3 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
ParpbpQ6IRT3 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
ParpbpQ6IRT3 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
ParpbpQ6IRT3 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
ParpbpQ6IRT3 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
ParpbpQ6IRT3 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
ParpbpQ6IRT3 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
ParpbpQ6IRT3 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
ParpbpQ6IRT3 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
ParpbpQ6IRT3 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
ParpbpQ6IRT3 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
ParpbpQ6IRT3 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
ParpbpQ6IRT3 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
ParpbpQ6IRT3 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
ParpbpQ6IRT3 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
ParpbpQ6IRT3 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
ParpbpQ6IRT3 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
ParpbpQ6IRT3 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
ParpbpQ6IRT3 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
ParpbpQ6IRT3 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
ParpbpQ6IRT3 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
ParpbpQ6IRT3 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
ParpbpQ6IRT3 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
ParpbpQ6IRT3 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
ParpbpQ6IRT3 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
ParpbpQ6IRT3 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
ParpbpQ6IRT3 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
ParpbpQ6IRT3 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
ParpbpQ6IRT3 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
ParpbpQ6IRT3 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
ParpbpQ6IRT3 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
ParpbpQ6IRT3 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
ParpbpQ6IRT3 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
ParpbpQ6IRT3 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
ParpbpQ6IRT3 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
ParpbpQ6IRT3 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
ParpbpQ6IRT3 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
ParpbpQ6IRT3 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
ParpbpQ6IRT3 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
ParpbpQ6IRT3 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
ParpbpQ6IRT3 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
ParpbpQ6IRT3 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
ParpbpQ6IRT3 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
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