Protein–RNA interactions for Protein: Q6A078

Cep290, Centrosomal protein of 290 kDa, mousemouse

Predictions only

Length 2,472 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cep290Q6A078 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cep290Q6A078 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cep290Q6A078 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cep290Q6A078 Gm10244-201ENSMUST00000090237 830 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cep290Q6A078 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cep290Q6A078 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Cep290Q6A078 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cep290Q6A078 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cep290Q6A078 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cep290Q6A078 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cep290Q6A078 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cep290Q6A078 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cep290Q6A078 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cep290Q6A078 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cep290Q6A078 Rgs20-203ENSMUST00000119256 883 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cep290Q6A078 Gm13829-201ENSMUST00000119600 138 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
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Cep290Q6A078 Gm25144-201ENSMUST00000179561 110 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Cep290Q6A078 Gm25352-201ENSMUST00000179815 110 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Cep290Q6A078 Pltp-201ENSMUST00000059954 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cep290Q6A078 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
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Cep290Q6A078 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cep290Q6A078 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cep290Q6A078 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cep290Q6A078 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cep290Q6A078 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cep290Q6A078 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cep290Q6A078 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cep290Q6A078 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cep290Q6A078 Myl4-203ENSMUST00000106957 943 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
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Cep290Q6A078 Gm11478-201ENSMUST00000117851 599 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Cep290Q6A078 Hras-203ENSMUST00000124314 1073 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
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Cep290Q6A078 Gm12212-201ENSMUST00000141032 378 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cep290Q6A078 AL593843.1-201ENSMUST00000195891 145 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
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Cep290Q6A078 Hsd17b14-205ENSMUST00000210300 797 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cep290Q6A078 Myl6b-201ENSMUST00000026428 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
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Cep290Q6A078 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
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Cep290Q6A078 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cep290Q6A078 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cep290Q6A078 Gm6973-201ENSMUST00000117080 721 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Cep290Q6A078 Gm13066-201ENSMUST00000145263 884 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cep290Q6A078 Mrps24-205ENSMUST00000154330 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cep290Q6A078 Pkig-209ENSMUST00000164399 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cep290Q6A078 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cep290Q6A078 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cep290Q6A078 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
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Cep290Q6A078 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Cep290Q6A078 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Cep290Q6A078 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Cep290Q6A078 AC166341.4-201ENSMUST00000220625 123 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
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Cep290Q6A078 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cep290Q6A078 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
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Cep290Q6A078 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
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Cep290Q6A078 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Cep290Q6A078 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cep290Q6A078 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cep290Q6A078 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cep290Q6A078 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cep290Q6A078 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cep290Q6A078 Tnfrsf12a-202ENSMUST00000167059 858 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cep290Q6A078 Gm18737-201ENSMUST00000173594 937 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Cep290Q6A078 Tnfrsf12a-201ENSMUST00000024698 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cep290Q6A078 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cep290Q6A078 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cep290Q6A078 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Cep290Q6A078 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cep290Q6A078 Dpp7-201ENSMUST00000028332 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cep290Q6A078 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cep290Q6A078 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cep290Q6A078 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cep290Q6A078 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cep290Q6A078 Crybb2-201ENSMUST00000031295 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cep290Q6A078 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cep290Q6A078 Ntf3-201ENSMUST00000050484 1483 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cep290Q6A078 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cep290Q6A078 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cep290Q6A078 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cep290Q6A078 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.1 ms