Protein–RNA interactions for Protein: Q69ZL1

Fgd6, FYVE, RhoGEF and PH domain-containing protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 1,399 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fgd6Q69ZL1 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Fgd6Q69ZL1 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Fgd6Q69ZL1 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Fgd6Q69ZL1 Nmi-202ENSMUST00000112705 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Fgd6Q69ZL1 Dnase1l1-203ENSMUST00000114189 755 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Fgd6Q69ZL1 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Fgd6Q69ZL1 Mrps24-205ENSMUST00000154330 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Fgd6Q69ZL1 Tnfrsf12a-202ENSMUST00000167059 858 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Fgd6Q69ZL1 Tnfrsf12a-201ENSMUST00000024698 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Fgd6Q69ZL1 Caly-201ENSMUST00000026541 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Fgd6Q69ZL1 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Fgd6Q69ZL1 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Fgd6Q69ZL1 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Fgd6Q69ZL1 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Fgd6Q69ZL1 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Fgd6Q69ZL1 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Fgd6Q69ZL1 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Fgd6Q69ZL1 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Fgd6Q69ZL1 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Fgd6Q69ZL1 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Fgd6Q69ZL1 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Fgd6Q69ZL1 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Fgd6Q69ZL1 Gm11478-201ENSMUST00000117851 599 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
Fgd6Q69ZL1 Sh3bgrl3-201ENSMUST00000030651 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Fgd6Q69ZL1 Pdlim7-203ENSMUST00000069968 1006 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Fgd6Q69ZL1 Rpl13a-ps1-201ENSMUST00000071866 612 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Fgd6Q69ZL1 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Fgd6Q69ZL1 Syt8-201ENSMUST00000097939 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Fgd6Q69ZL1 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Fgd6Q69ZL1 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Fgd6Q69ZL1 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Fgd6Q69ZL1 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Fgd6Q69ZL1 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Fgd6Q69ZL1 Plekhb1-207ENSMUST00000116287 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Fgd6Q69ZL1 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Fgd6Q69ZL1 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Fgd6Q69ZL1 Gm8334-201ENSMUST00000112755 1662 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Fgd6Q69ZL1 Mettl26-203ENSMUST00000163356 534 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Fgd6Q69ZL1 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
Fgd6Q69ZL1 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC24.14■■□□□ 1.46
Fgd6Q69ZL1 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Fgd6Q69ZL1 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Fgd6Q69ZL1 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Fgd6Q69ZL1 Hnrnph2-201ENSMUST00000050331 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Fgd6Q69ZL1 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Fgd6Q69ZL1 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Fgd6Q69ZL1 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Fgd6Q69ZL1 Fcnb-202ENSMUST00000117486 873 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Fgd6Q69ZL1 Rps13-ps4-201ENSMUST00000117927 456 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
Fgd6Q69ZL1 Rps13-ps5-201ENSMUST00000117939 456 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
Fgd6Q69ZL1 Orai3-202ENSMUST00000118865 768 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Fgd6Q69ZL1 Gm15483-201ENSMUST00000120338 456 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
Fgd6Q69ZL1 1700047K16Rik-201ENSMUST00000145068 886 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Fgd6Q69ZL1 Gm29667-201ENSMUST00000190817 490 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
Fgd6Q69ZL1 Gm6007-201ENSMUST00000208170 823 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
Fgd6Q69ZL1 Cradd-202ENSMUST00000217809 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Fgd6Q69ZL1 Tmod4-201ENSMUST00000005769 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Fgd6Q69ZL1 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Fgd6Q69ZL1 Rplp0-201ENSMUST00000086519 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Fgd6Q69ZL1 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Fgd6Q69ZL1 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Fgd6Q69ZL1 Plppr2-202ENSMUST00000188468 1480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Fgd6Q69ZL1 Cldn14-201ENSMUST00000050962 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Fgd6Q69ZL1 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Fgd6Q69ZL1 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Fgd6Q69ZL1 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Fgd6Q69ZL1 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Fgd6Q69ZL1 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Fgd6Q69ZL1 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Fgd6Q69ZL1 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Fgd6Q69ZL1 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Fgd6Q69ZL1 H2afb1-201ENSMUST00000122446 348 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Fgd6Q69ZL1 Rab11fip4os2-201ENSMUST00000123067 689 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Fgd6Q69ZL1 Mroh1-217ENSMUST00000162319 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Fgd6Q69ZL1 Gm38319-201ENSMUST00000194537 1266 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
Fgd6Q69ZL1 Gm45059-201ENSMUST00000205558 1077 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
Fgd6Q69ZL1 Gm33337-201ENSMUST00000219594 228 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Fgd6Q69ZL1 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Fgd6Q69ZL1 Cldn9-201ENSMUST00000085989 1435 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Fgd6Q69ZL1 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Fgd6Q69ZL1 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Fgd6Q69ZL1 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Fgd6Q69ZL1 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Fgd6Q69ZL1 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Fgd6Q69ZL1 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
Fgd6Q69ZL1 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Fgd6Q69ZL1 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Fgd6Q69ZL1 Gm833-201ENSMUST00000143133 884 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Fgd6Q69ZL1 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Fgd6Q69ZL1 Gm36979-201ENSMUST00000193616 539 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Fgd6Q69ZL1 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
Fgd6Q69ZL1 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Fgd6Q69ZL1 Tspan3-203ENSMUST00000215906 842 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Fgd6Q69ZL1 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Fgd6Q69ZL1 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Fgd6Q69ZL1 Slc22a18-201ENSMUST00000052348 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Fgd6Q69ZL1 Arxes2-201ENSMUST00000058119 1532 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Fgd6Q69ZL1 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Fgd6Q69ZL1 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Fgd6Q69ZL1 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.1 ms