Protein–RNA interactions for Protein: Q69ZB8

Zcchc2, Zinc finger CCHC domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,166 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zcchc2Q69ZB8 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Zcchc2Q69ZB8 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Zcchc2Q69ZB8 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Zcchc2Q69ZB8 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Zcchc2Q69ZB8 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Zcchc2Q69ZB8 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Zcchc2Q69ZB8 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Zcchc2Q69ZB8 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Zcchc2Q69ZB8 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Zcchc2Q69ZB8 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Zcchc2Q69ZB8 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Zcchc2Q69ZB8 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Zcchc2Q69ZB8 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Zcchc2Q69ZB8 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Zcchc2Q69ZB8 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Zcchc2Q69ZB8 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Zcchc2Q69ZB8 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Zcchc2Q69ZB8 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Zcchc2Q69ZB8 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Zcchc2Q69ZB8 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Zcchc2Q69ZB8 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Zcchc2Q69ZB8 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Zcchc2Q69ZB8 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Zcchc2Q69ZB8 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Zcchc2Q69ZB8 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Zcchc2Q69ZB8 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Zcchc2Q69ZB8 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Zcchc2Q69ZB8 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Zcchc2Q69ZB8 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Zcchc2Q69ZB8 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Zcchc2Q69ZB8 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Zcchc2Q69ZB8 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Zcchc2Q69ZB8 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Zcchc2Q69ZB8 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Zcchc2Q69ZB8 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Zcchc2Q69ZB8 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Zcchc2Q69ZB8 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Zcchc2Q69ZB8 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Zcchc2Q69ZB8 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Zcchc2Q69ZB8 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Zcchc2Q69ZB8 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Zcchc2Q69ZB8 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Zcchc2Q69ZB8 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Zcchc2Q69ZB8 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Zcchc2Q69ZB8 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Zcchc2Q69ZB8 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Zcchc2Q69ZB8 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Zcchc2Q69ZB8 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Zcchc2Q69ZB8 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Zcchc2Q69ZB8 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Zcchc2Q69ZB8 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Zcchc2Q69ZB8 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Zcchc2Q69ZB8 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Zcchc2Q69ZB8 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Zcchc2Q69ZB8 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Zcchc2Q69ZB8 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Zcchc2Q69ZB8 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Zcchc2Q69ZB8 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Zcchc2Q69ZB8 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Zcchc2Q69ZB8 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Zcchc2Q69ZB8 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Zcchc2Q69ZB8 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Zcchc2Q69ZB8 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Zcchc2Q69ZB8 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Zcchc2Q69ZB8 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Zcchc2Q69ZB8 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Zcchc2Q69ZB8 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Zcchc2Q69ZB8 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Zcchc2Q69ZB8 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Zcchc2Q69ZB8 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Zcchc2Q69ZB8 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Zcchc2Q69ZB8 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Zcchc2Q69ZB8 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Zcchc2Q69ZB8 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Zcchc2Q69ZB8 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Zcchc2Q69ZB8 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Zcchc2Q69ZB8 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Zcchc2Q69ZB8 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Zcchc2Q69ZB8 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Zcchc2Q69ZB8 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Zcchc2Q69ZB8 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Zcchc2Q69ZB8 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Zcchc2Q69ZB8 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Zcchc2Q69ZB8 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Zcchc2Q69ZB8 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Zcchc2Q69ZB8 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Zcchc2Q69ZB8 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Zcchc2Q69ZB8 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Zcchc2Q69ZB8 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Zcchc2Q69ZB8 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Zcchc2Q69ZB8 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Zcchc2Q69ZB8 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Zcchc2Q69ZB8 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Zcchc2Q69ZB8 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Zcchc2Q69ZB8 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Zcchc2Q69ZB8 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Zcchc2Q69ZB8 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Zcchc2Q69ZB8 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Zcchc2Q69ZB8 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Zcchc2Q69ZB8 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.1 ms