Protein–RNA interactions for Protein: Q69ZA1

Cdk13, Cyclin-dependent kinase 13, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,511 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdk13Q69ZA1 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cdk13Q69ZA1 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cdk13Q69ZA1 Lcn5-202ENSMUST00000100312 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cdk13Q69ZA1 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cdk13Q69ZA1 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Cdk13Q69ZA1 Med10-204ENSMUST00000221893 815 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cdk13Q69ZA1 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cdk13Q69ZA1 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cdk13Q69ZA1 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cdk13Q69ZA1 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cdk13Q69ZA1 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cdk13Q69ZA1 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cdk13Q69ZA1 Plekhb1-202ENSMUST00000107043 931 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cdk13Q69ZA1 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cdk13Q69ZA1 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Cdk13Q69ZA1 Lcn5-201ENSMUST00000028306 696 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cdk13Q69ZA1 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cdk13Q69ZA1 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cdk13Q69ZA1 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cdk13Q69ZA1 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cdk13Q69ZA1 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cdk13Q69ZA1 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cdk13Q69ZA1 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cdk13Q69ZA1 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cdk13Q69ZA1 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cdk13Q69ZA1 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cdk13Q69ZA1 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cdk13Q69ZA1 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cdk13Q69ZA1 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cdk13Q69ZA1 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cdk13Q69ZA1 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cdk13Q69ZA1 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Cdk13Q69ZA1 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Cdk13Q69ZA1 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Cdk13Q69ZA1 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Cdk13Q69ZA1 Gm26935-201ENSMUST00000182686 519 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cdk13Q69ZA1 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Cdk13Q69ZA1 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Cdk13Q69ZA1 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cdk13Q69ZA1 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Cdk13Q69ZA1 Gm10322-201ENSMUST00000095646 336 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cdk13Q69ZA1 Gm27198-201ENSMUST00000184172 1517 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cdk13Q69ZA1 1700010B13Rik-202ENSMUST00000189435 1549 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cdk13Q69ZA1 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cdk13Q69ZA1 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Cdk13Q69ZA1 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cdk13Q69ZA1 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cdk13Q69ZA1 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cdk13Q69ZA1 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cdk13Q69ZA1 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cdk13Q69ZA1 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Cdk13Q69ZA1 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Cdk13Q69ZA1 Cdipt-205ENSMUST00000206450 951 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Cdk13Q69ZA1 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Cdk13Q69ZA1 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Cdk13Q69ZA1 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Cdk13Q69ZA1 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Cdk13Q69ZA1 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
Cdk13Q69ZA1 H1fnt-201ENSMUST00000060855 1326 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Cdk13Q69ZA1 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Cdk13Q69ZA1 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cdk13Q69ZA1 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cdk13Q69ZA1 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cdk13Q69ZA1 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cdk13Q69ZA1 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cdk13Q69ZA1 Gm11745-201ENSMUST00000121669 448 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Cdk13Q69ZA1 2010015M23Rik-201ENSMUST00000181900 1199 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cdk13Q69ZA1 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cdk13Q69ZA1 Cartpt-201ENSMUST00000022150 827 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cdk13Q69ZA1 Cartpt-202ENSMUST00000224142 1238 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cdk13Q69ZA1 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cdk13Q69ZA1 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cdk13Q69ZA1 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cdk13Q69ZA1 Pou2f3-rs1-201ENSMUST00000120271 1046 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Cdk13Q69ZA1 Gm15825-201ENSMUST00000159108 918 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cdk13Q69ZA1 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Cdk13Q69ZA1 Mesp1-201ENSMUST00000032760 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cdk13Q69ZA1 Gm11937-201ENSMUST00000076478 396 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cdk13Q69ZA1 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cdk13Q69ZA1 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cdk13Q69ZA1 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cdk13Q69ZA1 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cdk13Q69ZA1 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cdk13Q69ZA1 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cdk13Q69ZA1 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cdk13Q69ZA1 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cdk13Q69ZA1 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cdk13Q69ZA1 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cdk13Q69ZA1 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cdk13Q69ZA1 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cdk13Q69ZA1 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cdk13Q69ZA1 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cdk13Q69ZA1 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cdk13Q69ZA1 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cdk13Q69ZA1 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cdk13Q69ZA1 Umad1-206ENSMUST00000160705 624 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cdk13Q69ZA1 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cdk13Q69ZA1 Cd3g-201ENSMUST00000002101 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cdk13Q69ZA1 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cdk13Q69ZA1 Spsb2-201ENSMUST00000047760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.7 ms