Protein–RNA interactions for Protein: Q68FE2

Atg9a, Autophagy-related protein 9A, mousemouse

Predictions only

Length 551 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg9aQ68FE2 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Atg9aQ68FE2 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Atg9aQ68FE2 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Atg9aQ68FE2 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Atg9aQ68FE2 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Atg9aQ68FE2 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Atg9aQ68FE2 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Atg9aQ68FE2 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Atg9aQ68FE2 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Atg9aQ68FE2 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Atg9aQ68FE2 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Atg9aQ68FE2 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Atg9aQ68FE2 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Atg9aQ68FE2 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Atg9aQ68FE2 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Atg9aQ68FE2 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Atg9aQ68FE2 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Atg9aQ68FE2 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Atg9aQ68FE2 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Atg9aQ68FE2 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Atg9aQ68FE2 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Atg9aQ68FE2 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Atg9aQ68FE2 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Atg9aQ68FE2 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Atg9aQ68FE2 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Atg9aQ68FE2 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Atg9aQ68FE2 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Atg9aQ68FE2 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Atg9aQ68FE2 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Atg9aQ68FE2 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Atg9aQ68FE2 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Atg9aQ68FE2 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Atg9aQ68FE2 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Atg9aQ68FE2 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Atg9aQ68FE2 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Atg9aQ68FE2 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Atg9aQ68FE2 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Atg9aQ68FE2 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Atg9aQ68FE2 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Atg9aQ68FE2 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Atg9aQ68FE2 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Atg9aQ68FE2 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Atg9aQ68FE2 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
Atg9aQ68FE2 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Atg9aQ68FE2 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
Atg9aQ68FE2 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Atg9aQ68FE2 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Atg9aQ68FE2 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Atg9aQ68FE2 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Atg9aQ68FE2 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Atg9aQ68FE2 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Atg9aQ68FE2 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
Atg9aQ68FE2 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Atg9aQ68FE2 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Atg9aQ68FE2 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Atg9aQ68FE2 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Atg9aQ68FE2 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Atg9aQ68FE2 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Atg9aQ68FE2 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Atg9aQ68FE2 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Atg9aQ68FE2 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Atg9aQ68FE2 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Atg9aQ68FE2 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Atg9aQ68FE2 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Atg9aQ68FE2 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Atg9aQ68FE2 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Atg9aQ68FE2 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Atg9aQ68FE2 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Atg9aQ68FE2 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Atg9aQ68FE2 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Atg9aQ68FE2 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Atg9aQ68FE2 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Atg9aQ68FE2 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Atg9aQ68FE2 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Atg9aQ68FE2 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Atg9aQ68FE2 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Atg9aQ68FE2 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Atg9aQ68FE2 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Atg9aQ68FE2 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Atg9aQ68FE2 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Atg9aQ68FE2 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Atg9aQ68FE2 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Atg9aQ68FE2 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Atg9aQ68FE2 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Atg9aQ68FE2 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Atg9aQ68FE2 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Atg9aQ68FE2 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Atg9aQ68FE2 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Atg9aQ68FE2 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Atg9aQ68FE2 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Atg9aQ68FE2 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Atg9aQ68FE2 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Atg9aQ68FE2 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Atg9aQ68FE2 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Atg9aQ68FE2 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Atg9aQ68FE2 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Atg9aQ68FE2 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Atg9aQ68FE2 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Atg9aQ68FE2 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Atg9aQ68FE2 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.2 ms