Protein–RNA interactions for Protein: Q64HY3

Sp9, Transcription factor Sp9, mousemouse

Predictions only

Length 484 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sp9Q64HY3 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sp9Q64HY3 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
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Sp9Q64HY3 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sp9Q64HY3 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sp9Q64HY3 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sp9Q64HY3 1700113H08Rik-201ENSMUST00000169849 1332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sp9Q64HY3 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sp9Q64HY3 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sp9Q64HY3 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sp9Q64HY3 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
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Sp9Q64HY3 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sp9Q64HY3 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sp9Q64HY3 Sept1-201ENSMUST00000106313 1285 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
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Sp9Q64HY3 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sp9Q64HY3 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sp9Q64HY3 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
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Sp9Q64HY3 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
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Sp9Q64HY3 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sp9Q64HY3 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
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Sp9Q64HY3 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sp9Q64HY3 1700055C04Rik-201ENSMUST00000176450 355 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sp9Q64HY3 Pomc-201ENSMUST00000020990 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
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Sp9Q64HY3 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sp9Q64HY3 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sp9Q64HY3 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sp9Q64HY3 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sp9Q64HY3 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sp9Q64HY3 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sp9Q64HY3 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
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Sp9Q64HY3 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sp9Q64HY3 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sp9Q64HY3 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sp9Q64HY3 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
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Sp9Q64HY3 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sp9Q64HY3 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
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Sp9Q64HY3 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
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Sp9Q64HY3 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sp9Q64HY3 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
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Sp9Q64HY3 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sp9Q64HY3 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.9 ms