Protein–RNA interactions for Protein: Q64727

Vcl, Vinculin, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,066 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VclQ64727 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
VclQ64727 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
VclQ64727 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
VclQ64727 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
VclQ64727 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
VclQ64727 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
VclQ64727 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
VclQ64727 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
VclQ64727 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
VclQ64727 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
VclQ64727 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
VclQ64727 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
VclQ64727 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
VclQ64727 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
VclQ64727 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
VclQ64727 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
VclQ64727 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
VclQ64727 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
VclQ64727 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
VclQ64727 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
VclQ64727 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
VclQ64727 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
VclQ64727 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
VclQ64727 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
VclQ64727 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
VclQ64727 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
VclQ64727 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
VclQ64727 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
VclQ64727 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
VclQ64727 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
VclQ64727 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
VclQ64727 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
VclQ64727 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
VclQ64727 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
VclQ64727 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
VclQ64727 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
VclQ64727 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
VclQ64727 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
VclQ64727 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
VclQ64727 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
VclQ64727 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
VclQ64727 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
VclQ64727 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
VclQ64727 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
VclQ64727 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
VclQ64727 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
VclQ64727 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
VclQ64727 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
VclQ64727 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
VclQ64727 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
VclQ64727 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
VclQ64727 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
VclQ64727 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
VclQ64727 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
VclQ64727 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
VclQ64727 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
VclQ64727 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
VclQ64727 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
VclQ64727 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
VclQ64727 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
VclQ64727 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
VclQ64727 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
VclQ64727 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
VclQ64727 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
VclQ64727 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
VclQ64727 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
VclQ64727 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
VclQ64727 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
VclQ64727 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
VclQ64727 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
VclQ64727 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
VclQ64727 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
VclQ64727 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
VclQ64727 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
VclQ64727 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
VclQ64727 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
VclQ64727 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
VclQ64727 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
VclQ64727 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
VclQ64727 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
VclQ64727 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
VclQ64727 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
VclQ64727 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
VclQ64727 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
VclQ64727 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
VclQ64727 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
VclQ64727 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
VclQ64727 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
VclQ64727 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
VclQ64727 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
VclQ64727 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
VclQ64727 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
VclQ64727 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
VclQ64727 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
VclQ64727 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
VclQ64727 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
VclQ64727 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
VclQ64727 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
VclQ64727 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
VclQ64727 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.6 ms