Protein–RNA interactions for Protein: Q64705

Usf2, Upstream stimulatory factor 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 346 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usf2Q64705 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Usf2Q64705 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Usf2Q64705 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Usf2Q64705 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Usf2Q64705 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Usf2Q64705 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Usf2Q64705 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Usf2Q64705 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Usf2Q64705 Ss18-201ENSMUST00000040924 3090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Usf2Q64705 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Usf2Q64705 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Usf2Q64705 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Usf2Q64705 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Usf2Q64705 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Usf2Q64705 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Usf2Q64705 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Usf2Q64705 Nt5c2-203ENSMUST00000172239 3148 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Usf2Q64705 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Usf2Q64705 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Usf2Q64705 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Usf2Q64705 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Usf2Q64705 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Usf2Q64705 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Usf2Q64705 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Usf2Q64705 Gata2-201ENSMUST00000015197 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Usf2Q64705 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Usf2Q64705 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Usf2Q64705 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Usf2Q64705 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Usf2Q64705 Kctd20-202ENSMUST00000117672 2219 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Usf2Q64705 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Usf2Q64705 Nphp4-202ENSMUST00000081393 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Usf2Q64705 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Usf2Q64705 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Usf2Q64705 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Usf2Q64705 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Usf2Q64705 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Usf2Q64705 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Usf2Q64705 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Usf2Q64705 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Usf2Q64705 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Usf2Q64705 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Usf2Q64705 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Usf2Q64705 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Usf2Q64705 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Usf2Q64705 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Usf2Q64705 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Usf2Q64705 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Usf2Q64705 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Usf2Q64705 Tle3-201ENSMUST00000034820 4646 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Usf2Q64705 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Usf2Q64705 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC13.46□□□□□ -0.26
Usf2Q64705 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Usf2Q64705 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Usf2Q64705 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Usf2Q64705 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Usf2Q64705 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Usf2Q64705 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Usf2Q64705 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Usf2Q64705 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Usf2Q64705 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Usf2Q64705 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Usf2Q64705 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Usf2Q64705 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Usf2Q64705 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Usf2Q64705 Ap3d1-201ENSMUST00000020420 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Usf2Q64705 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Usf2Q64705 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Usf2Q64705 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Usf2Q64705 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Usf2Q64705 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Usf2Q64705 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Usf2Q64705 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Usf2Q64705 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Usf2Q64705 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Usf2Q64705 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Usf2Q64705 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Usf2Q64705 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Usf2Q64705 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Usf2Q64705 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Usf2Q64705 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Usf2Q64705 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Usf2Q64705 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Usf2Q64705 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Usf2Q64705 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Usf2Q64705 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Usf2Q64705 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Usf2Q64705 Gpr85-201ENSMUST00000060442 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Usf2Q64705 Otud4-203ENSMUST00000173286 7213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Usf2Q64705 Srsf10-204ENSMUST00000105853 3058 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Usf2Q64705 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Usf2Q64705 Rbm26-201ENSMUST00000022715 3633 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Usf2Q64705 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Usf2Q64705 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Usf2Q64705 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Usf2Q64705 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Usf2Q64705 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Usf2Q64705 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Usf2Q64705 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Usf2Q64705 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.7 ms