Protein–RNA interactions for Protein: Q64016

Defa17, Alpha-defensin 17 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 82 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa17Q64016 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Defa17Q64016 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Defa17Q64016 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Defa17Q64016 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Defa17Q64016 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Defa17Q64016 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
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Defa17Q64016 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
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Defa17Q64016 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Defa17Q64016 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Defa17Q64016 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
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Defa17Q64016 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
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Defa17Q64016 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Defa17Q64016 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Defa17Q64016 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Defa17Q64016 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Defa17Q64016 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Defa17Q64016 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Defa17Q64016 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Defa17Q64016 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Defa17Q64016 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Defa17Q64016 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Defa17Q64016 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Defa17Q64016 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Defa17Q64016 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Defa17Q64016 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Defa17Q64016 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Defa17Q64016 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Defa17Q64016 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Defa17Q64016 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Defa17Q64016 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Defa17Q64016 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Defa17Q64016 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Defa17Q64016 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Defa17Q64016 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Defa17Q64016 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Defa17Q64016 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Defa17Q64016 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Defa17Q64016 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Defa17Q64016 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Defa17Q64016 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Defa17Q64016 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Defa17Q64016 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Defa17Q64016 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
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Defa17Q64016 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Defa17Q64016 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Defa17Q64016 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Defa17Q64016 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Defa17Q64016 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Defa17Q64016 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Defa17Q64016 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Defa17Q64016 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Defa17Q64016 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Defa17Q64016 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Defa17Q64016 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Defa17Q64016 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Defa17Q64016 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Defa17Q64016 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
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Defa17Q64016 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Defa17Q64016 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Defa17Q64016 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Defa17Q64016 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Defa17Q64016 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Defa17Q64016 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Defa17Q64016 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Defa17Q64016 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Defa17Q64016 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Defa17Q64016 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Defa17Q64016 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Defa17Q64016 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Defa17Q64016 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Defa17Q64016 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Defa17Q64016 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Defa17Q64016 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Defa17Q64016 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Defa17Q64016 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Defa17Q64016 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Defa17Q64016 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Defa17Q64016 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Defa17Q64016 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Defa17Q64016 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Defa17Q64016 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Defa17Q64016 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Defa17Q64016 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Defa17Q64016 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Defa17Q64016 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Defa17Q64016 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Defa17Q64016 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Defa17Q64016 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.7 ms