Protein–RNA interactions for Protein: Q62442

Vamp1, Vesicle-associated membrane protein 1, mousemouse

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Length 118 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vamp1Q62442 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Vamp1Q62442 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Vamp1Q62442 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Vamp1Q62442 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Vamp1Q62442 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Vamp1Q62442 Gm43339-201ENSMUST00000200032 1606 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Vamp1Q62442 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Vamp1Q62442 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Vamp1Q62442 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Vamp1Q62442 Kif21b-201ENSMUST00000075164 9115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Vamp1Q62442 Satb2-201ENSMUST00000042857 6277 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Vamp1Q62442 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Vamp1Q62442 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Vamp1Q62442 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Vamp1Q62442 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Vamp1Q62442 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Vamp1Q62442 Gm37744-201ENSMUST00000194616 1590 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Vamp1Q62442 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Vamp1Q62442 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Vamp1Q62442 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Vamp1Q62442 Arhgap26-201ENSMUST00000097593 7898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Vamp1Q62442 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Vamp1Q62442 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Vamp1Q62442 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Vamp1Q62442 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Vamp1Q62442 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Vamp1Q62442 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Vamp1Q62442 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Vamp1Q62442 Clec16a-211ENSMUST00000155633 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Vamp1Q62442 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Vamp1Q62442 2700080J24Rik-201ENSMUST00000205314 1662 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Vamp1Q62442 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Vamp1Q62442 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Vamp1Q62442 Cacna2d1-205ENSMUST00000167946 7436 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Vamp1Q62442 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Vamp1Q62442 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Vamp1Q62442 Tle3-201ENSMUST00000034820 4646 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Vamp1Q62442 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Vamp1Q62442 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Vamp1Q62442 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Vamp1Q62442 Patz1-207ENSMUST00000134089 1904 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Vamp1Q62442 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Vamp1Q62442 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Vamp1Q62442 Clip2-201ENSMUST00000036999 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Vamp1Q62442 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC13.58□□□□□ -0.23
Vamp1Q62442 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
Vamp1Q62442 Ube3a-201ENSMUST00000107537 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Vamp1Q62442 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Vamp1Q62442 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Vamp1Q62442 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Vamp1Q62442 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Vamp1Q62442 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Vamp1Q62442 Grin3a-202ENSMUST00000093859 7491 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Vamp1Q62442 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
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Vamp1Q62442 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Vamp1Q62442 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Vamp1Q62442 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Vamp1Q62442 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Vamp1Q62442 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Vamp1Q62442 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Vamp1Q62442 Vrk1-204ENSMUST00000220629 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Vamp1Q62442 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Vamp1Q62442 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Vamp1Q62442 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Vamp1Q62442 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Vamp1Q62442 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Vamp1Q62442 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Vamp1Q62442 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Vamp1Q62442 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Vamp1Q62442 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Vamp1Q62442 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Vamp1Q62442 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Vamp1Q62442 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Vamp1Q62442 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Vamp1Q62442 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Vamp1Q62442 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Vamp1Q62442 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Vamp1Q62442 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Vamp1Q62442 Sugp2-214ENSMUST00000164403 4099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Vamp1Q62442 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Vamp1Q62442 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Vamp1Q62442 Ghr-201ENSMUST00000069451 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Vamp1Q62442 Zfyve27-207ENSMUST00000169536 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Vamp1Q62442 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Vamp1Q62442 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Vamp1Q62442 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Vamp1Q62442 Meioc-201ENSMUST00000100378 4573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Vamp1Q62442 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Vamp1Q62442 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Vamp1Q62442 Lifr-201ENSMUST00000067190 4143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Vamp1Q62442 Ttc3-201ENSMUST00000117648 7417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Vamp1Q62442 Kif7-203ENSMUST00000183846 4577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Vamp1Q62442 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Vamp1Q62442 Tsn-201ENSMUST00000027623 7063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Vamp1Q62442 Ptger1-201ENSMUST00000019608 4694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Vamp1Q62442 Kank2-201ENSMUST00000034717 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Vamp1Q62442 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Vamp1Q62442 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Vamp1Q62442 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
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