Protein–RNA interactions for Protein: Q62393

Tpd52, Tumor protein D52, mousemouse

Predictions only

Length 224 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tpd52Q62393 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Tpd52Q62393 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Tpd52Q62393 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Tpd52Q62393 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Tpd52Q62393 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Tpd52Q62393 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Tpd52Q62393 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Tpd52Q62393 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Tpd52Q62393 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Tpd52Q62393 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Tpd52Q62393 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Tpd52Q62393 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Tpd52Q62393 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Tpd52Q62393 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Tpd52Q62393 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Tpd52Q62393 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Tpd52Q62393 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Tpd52Q62393 Gm44335-201ENSMUST00000196879 141 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Tpd52Q62393 Gm44297-201ENSMUST00000198304 141 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Tpd52Q62393 Gm44346-201ENSMUST00000198851 141 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Tpd52Q62393 Pcna-ps2-201ENSMUST00000088040 1257 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Tpd52Q62393 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Tpd52Q62393 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Tpd52Q62393 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Tpd52Q62393 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Tpd52Q62393 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Tpd52Q62393 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Tpd52Q62393 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Tpd52Q62393 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Tpd52Q62393 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Tpd52Q62393 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Tpd52Q62393 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Tpd52Q62393 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Tpd52Q62393 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Tpd52Q62393 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Tpd52Q62393 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Tpd52Q62393 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Tpd52Q62393 Haghl-206ENSMUST00000138759 1074 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Tpd52Q62393 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Tpd52Q62393 AA543401-201ENSMUST00000164248 1269 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Tpd52Q62393 Zdhhc23-202ENSMUST00000165648 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Tpd52Q62393 Cyb561d2-205ENSMUST00000195235 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Tpd52Q62393 Timm13-201ENSMUST00000020440 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Tpd52Q62393 9430081H08Rik-201ENSMUST00000217460 818 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Tpd52Q62393 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Tpd52Q62393 Immp2l-201ENSMUST00000080160 239 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Tpd52Q62393 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Tpd52Q62393 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Tpd52Q62393 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Tpd52Q62393 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Tpd52Q62393 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Tpd52Q62393 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Tpd52Q62393 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Tpd52Q62393 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Tpd52Q62393 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Tpd52Q62393 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Tpd52Q62393 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Tpd52Q62393 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Tpd52Q62393 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Tpd52Q62393 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Tpd52Q62393 Ltc4s-202ENSMUST00000102772 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Tpd52Q62393 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Tpd52Q62393 Gm11745-201ENSMUST00000121669 448 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Tpd52Q62393 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Tpd52Q62393 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Tpd52Q62393 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Tpd52Q62393 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Tpd52Q62393 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Tpd52Q62393 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Tpd52Q62393 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Tpd52Q62393 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Tpd52Q62393 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Tpd52Q62393 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Tpd52Q62393 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Tpd52Q62393 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Tpd52Q62393 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Tpd52Q62393 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Tpd52Q62393 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Tpd52Q62393 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Tpd52Q62393 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Tpd52Q62393 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Tpd52Q62393 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Tpd52Q62393 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Tpd52Q62393 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Tpd52Q62393 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Tpd52Q62393 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Tpd52Q62393 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Tpd52Q62393 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Tpd52Q62393 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Tpd52Q62393 9530003J23Rik-202ENSMUST00000159193 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Tpd52Q62393 Runx2os2-201ENSMUST00000161664 818 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Tpd52Q62393 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Tpd52Q62393 1190007I07Rik-204ENSMUST00000183416 637 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Tpd52Q62393 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Tpd52Q62393 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Tpd52Q62393 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Tpd52Q62393 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Tpd52Q62393 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Tpd52Q62393 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Tpd52Q62393 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.8 ms