Protein–RNA interactions for Protein: Q62383

Supt6h, Transcription elongation factor SPT6, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,726 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Supt6hQ62383 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Supt6hQ62383 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Supt6hQ62383 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Supt6hQ62383 Spata3-209ENSMUST00000152501 743 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Supt6hQ62383 2410004P03Rik-203ENSMUST00000190691 953 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Supt6hQ62383 Trip6-203ENSMUST00000199121 366 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Supt6hQ62383 AC131710.1-201ENSMUST00000228336 990 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Supt6hQ62383 Rps10-201ENSMUST00000025052 519 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Supt6hQ62383 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Supt6hQ62383 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Supt6hQ62383 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Supt6hQ62383 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Supt6hQ62383 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Supt6hQ62383 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Supt6hQ62383 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Supt6hQ62383 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Supt6hQ62383 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Supt6hQ62383 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Supt6hQ62383 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Supt6hQ62383 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Supt6hQ62383 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Supt6hQ62383 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Supt6hQ62383 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Supt6hQ62383 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Supt6hQ62383 Gm25287-201ENSMUST00000103846 110 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Supt6hQ62383 Gm22918-201ENSMUST00000103855 110 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Supt6hQ62383 Metrnl-202ENSMUST00000106089 1101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Supt6hQ62383 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Supt6hQ62383 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Supt6hQ62383 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Supt6hQ62383 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Supt6hQ62383 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Supt6hQ62383 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Supt6hQ62383 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Supt6hQ62383 Gbgt1-203ENSMUST00000163121 1335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Supt6hQ62383 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Supt6hQ62383 Gm43691-201ENSMUST00000196625 697 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Supt6hQ62383 B9d2-203ENSMUST00000205658 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Supt6hQ62383 Tpi-rs5-201ENSMUST00000216947 774 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Supt6hQ62383 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Supt6hQ62383 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Supt6hQ62383 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Supt6hQ62383 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Supt6hQ62383 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Supt6hQ62383 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Supt6hQ62383 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Supt6hQ62383 Panct2-202ENSMUST00000188631 625 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Supt6hQ62383 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Supt6hQ62383 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Supt6hQ62383 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Supt6hQ62383 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Supt6hQ62383 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Supt6hQ62383 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Supt6hQ62383 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Supt6hQ62383 Crhr2-209ENSMUST00000213026 1443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Supt6hQ62383 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Supt6hQ62383 Lamtor3-201ENSMUST00000168345 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Supt6hQ62383 Mir7684-201ENSMUST00000183858 60 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Supt6hQ62383 Kansl3-206ENSMUST00000187628 336 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Supt6hQ62383 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Supt6hQ62383 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Supt6hQ62383 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Supt6hQ62383 Gm6018-201ENSMUST00000216090 1306 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Supt6hQ62383 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Supt6hQ62383 Prrg2-207ENSMUST00000210500 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Supt6hQ62383 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Supt6hQ62383 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Supt6hQ62383 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Supt6hQ62383 Agpat1-202ENSMUST00000114140 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Supt6hQ62383 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Supt6hQ62383 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Supt6hQ62383 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Supt6hQ62383 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Supt6hQ62383 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Supt6hQ62383 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Supt6hQ62383 Dnajc8-205ENSMUST00000105939 746 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Supt6hQ62383 Ppdpf-202ENSMUST00000108841 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Supt6hQ62383 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Supt6hQ62383 Mir99ahg-211ENSMUST00000183099 1189 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Supt6hQ62383 Gm7730-201ENSMUST00000212486 454 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Supt6hQ62383 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Supt6hQ62383 Rps15-201ENSMUST00000062674 572 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Supt6hQ62383 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Supt6hQ62383 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Supt6hQ62383 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Supt6hQ62383 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
Supt6hQ62383 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.23
Supt6hQ62383 Fam162a-201ENSMUST00000004057 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
Supt6hQ62383 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.23
Supt6hQ62383 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Supt6hQ62383 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Supt6hQ62383 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Supt6hQ62383 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Supt6hQ62383 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Supt6hQ62383 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Supt6hQ62383 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Supt6hQ62383 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Supt6hQ62383 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Supt6hQ62383 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Supt6hQ62383 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.2 ms