Protein–RNA interactions for Protein: Q61466

Smarcd1, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily D member 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 515 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smarcd1Q61466 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Smarcd1Q61466 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Smarcd1Q61466 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Smarcd1Q61466 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Smarcd1Q61466 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Smarcd1Q61466 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Smarcd1Q61466 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Smarcd1Q61466 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Smarcd1Q61466 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Smarcd1Q61466 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Smarcd1Q61466 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Smarcd1Q61466 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Smarcd1Q61466 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Smarcd1Q61466 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Smarcd1Q61466 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Smarcd1Q61466 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Smarcd1Q61466 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Smarcd1Q61466 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Smarcd1Q61466 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Smarcd1Q61466 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Smarcd1Q61466 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Smarcd1Q61466 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Smarcd1Q61466 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Smarcd1Q61466 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Smarcd1Q61466 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Smarcd1Q61466 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Smarcd1Q61466 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Smarcd1Q61466 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Smarcd1Q61466 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Smarcd1Q61466 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Smarcd1Q61466 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Smarcd1Q61466 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Smarcd1Q61466 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Smarcd1Q61466 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Smarcd1Q61466 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Smarcd1Q61466 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Smarcd1Q61466 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Smarcd1Q61466 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Smarcd1Q61466 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Smarcd1Q61466 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Smarcd1Q61466 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Smarcd1Q61466 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Smarcd1Q61466 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Smarcd1Q61466 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Smarcd1Q61466 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Smarcd1Q61466 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Smarcd1Q61466 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Smarcd1Q61466 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Smarcd1Q61466 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Smarcd1Q61466 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Smarcd1Q61466 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Smarcd1Q61466 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Smarcd1Q61466 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Smarcd1Q61466 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Smarcd1Q61466 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Smarcd1Q61466 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Smarcd1Q61466 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Smarcd1Q61466 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Smarcd1Q61466 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Smarcd1Q61466 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Smarcd1Q61466 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Smarcd1Q61466 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Smarcd1Q61466 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Smarcd1Q61466 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Smarcd1Q61466 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Smarcd1Q61466 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Smarcd1Q61466 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Smarcd1Q61466 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Smarcd1Q61466 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Smarcd1Q61466 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Smarcd1Q61466 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Smarcd1Q61466 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Smarcd1Q61466 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Smarcd1Q61466 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Smarcd1Q61466 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Smarcd1Q61466 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Smarcd1Q61466 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Smarcd1Q61466 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Smarcd1Q61466 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Smarcd1Q61466 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Smarcd1Q61466 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Smarcd1Q61466 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Smarcd1Q61466 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Smarcd1Q61466 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Smarcd1Q61466 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Smarcd1Q61466 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Smarcd1Q61466 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Smarcd1Q61466 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Smarcd1Q61466 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Smarcd1Q61466 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Smarcd1Q61466 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Smarcd1Q61466 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Smarcd1Q61466 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Smarcd1Q61466 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Smarcd1Q61466 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Smarcd1Q61466 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Smarcd1Q61466 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Smarcd1Q61466 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Smarcd1Q61466 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Smarcd1Q61466 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.9 ms