Protein–RNA interactions for Protein: Q60976

Jrk, Jerky protein, mousemouse

Predictions only

Length 557 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
JrkQ60976 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
JrkQ60976 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
JrkQ60976 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
JrkQ60976 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
JrkQ60976 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
JrkQ60976 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
JrkQ60976 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
JrkQ60976 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
JrkQ60976 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
JrkQ60976 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
JrkQ60976 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
JrkQ60976 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
JrkQ60976 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
JrkQ60976 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
JrkQ60976 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
JrkQ60976 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
JrkQ60976 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
JrkQ60976 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
JrkQ60976 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
JrkQ60976 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
JrkQ60976 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
JrkQ60976 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
JrkQ60976 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
JrkQ60976 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
JrkQ60976 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
JrkQ60976 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
JrkQ60976 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
JrkQ60976 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
JrkQ60976 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
JrkQ60976 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
JrkQ60976 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
JrkQ60976 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
JrkQ60976 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
JrkQ60976 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
JrkQ60976 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
JrkQ60976 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
JrkQ60976 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
JrkQ60976 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
JrkQ60976 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
JrkQ60976 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
JrkQ60976 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
JrkQ60976 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
JrkQ60976 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
JrkQ60976 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
JrkQ60976 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
JrkQ60976 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
JrkQ60976 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
JrkQ60976 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
JrkQ60976 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
JrkQ60976 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
JrkQ60976 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
JrkQ60976 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
JrkQ60976 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
JrkQ60976 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
JrkQ60976 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
JrkQ60976 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
JrkQ60976 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
JrkQ60976 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
JrkQ60976 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
JrkQ60976 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
JrkQ60976 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
JrkQ60976 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
JrkQ60976 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
JrkQ60976 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
JrkQ60976 Fxyd3-205ENSMUST00000167369 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
JrkQ60976 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
JrkQ60976 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
JrkQ60976 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
JrkQ60976 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
JrkQ60976 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
JrkQ60976 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
JrkQ60976 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
JrkQ60976 Klhdc8b-207ENSMUST00000193286 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
JrkQ60976 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
JrkQ60976 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
JrkQ60976 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
JrkQ60976 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
JrkQ60976 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
JrkQ60976 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
JrkQ60976 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
JrkQ60976 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
JrkQ60976 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
JrkQ60976 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
JrkQ60976 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
JrkQ60976 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
JrkQ60976 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
JrkQ60976 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
JrkQ60976 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
JrkQ60976 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
JrkQ60976 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
JrkQ60976 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
JrkQ60976 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
JrkQ60976 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
JrkQ60976 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
JrkQ60976 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
JrkQ60976 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
JrkQ60976 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
JrkQ60976 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
JrkQ60976 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
JrkQ60976 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.8 ms