Protein–RNA interactions for Protein: Q60972

Rbbp4, Histone-binding protein RBBP4, mousemouse

Predictions only

Length 425 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbbp4Q60972 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rbbp4Q60972 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rbbp4Q60972 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rbbp4Q60972 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rbbp4Q60972 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rbbp4Q60972 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rbbp4Q60972 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rbbp4Q60972 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rbbp4Q60972 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rbbp4Q60972 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rbbp4Q60972 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rbbp4Q60972 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rbbp4Q60972 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rbbp4Q60972 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rbbp4Q60972 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rbbp4Q60972 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rbbp4Q60972 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rbbp4Q60972 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Rbbp4Q60972 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Rbbp4Q60972 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Rbbp4Q60972 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Rbbp4Q60972 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Rbbp4Q60972 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Rbbp4Q60972 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Rbbp4Q60972 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Rbbp4Q60972 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Rbbp4Q60972 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Rbbp4Q60972 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Rbbp4Q60972 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Rbbp4Q60972 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Rbbp4Q60972 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Rbbp4Q60972 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Rbbp4Q60972 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Rbbp4Q60972 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Rbbp4Q60972 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Rbbp4Q60972 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Rbbp4Q60972 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Rbbp4Q60972 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Rbbp4Q60972 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Rbbp4Q60972 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Rbbp4Q60972 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Rbbp4Q60972 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Rbbp4Q60972 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Rbbp4Q60972 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Rbbp4Q60972 Piezo1-209ENSMUST00000156333 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Rbbp4Q60972 Piezo1-201ENSMUST00000067252 8216 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Rbbp4Q60972 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Rbbp4Q60972 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Rbbp4Q60972 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Rbbp4Q60972 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Rbbp4Q60972 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Rbbp4Q60972 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Rbbp4Q60972 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Rbbp4Q60972 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Rbbp4Q60972 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Rbbp4Q60972 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Rbbp4Q60972 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Rbbp4Q60972 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Rbbp4Q60972 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Rbbp4Q60972 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Rbbp4Q60972 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Rbbp4Q60972 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rbbp4Q60972 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rbbp4Q60972 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rbbp4Q60972 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
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Rbbp4Q60972 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Rbbp4Q60972 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rbbp4Q60972 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rbbp4Q60972 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rbbp4Q60972 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Rbbp4Q60972 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rbbp4Q60972 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rbbp4Q60972 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rbbp4Q60972 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rbbp4Q60972 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rbbp4Q60972 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rbbp4Q60972 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rbbp4Q60972 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Rbbp4Q60972 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rbbp4Q60972 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rbbp4Q60972 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rbbp4Q60972 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rbbp4Q60972 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rbbp4Q60972 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rbbp4Q60972 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rbbp4Q60972 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rbbp4Q60972 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rbbp4Q60972 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rbbp4Q60972 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Rbbp4Q60972 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Rbbp4Q60972 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Rbbp4Q60972 Itgav-201ENSMUST00000028499 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Rbbp4Q60972 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
Rbbp4Q60972 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Rbbp4Q60972 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Rbbp4Q60972 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Rbbp4Q60972 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Rbbp4Q60972 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Rbbp4Q60972 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
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