Protein–RNA interactions for Protein: Q60867

Neurod1, Neurogenic differentiation factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 357 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Neurod1Q60867 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Neurod1Q60867 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Neurod1Q60867 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Neurod1Q60867 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Neurod1Q60867 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Neurod1Q60867 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Neurod1Q60867 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Neurod1Q60867 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Neurod1Q60867 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Neurod1Q60867 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Neurod1Q60867 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Neurod1Q60867 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Neurod1Q60867 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Neurod1Q60867 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Neurod1Q60867 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Neurod1Q60867 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Neurod1Q60867 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Neurod1Q60867 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Neurod1Q60867 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Neurod1Q60867 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Neurod1Q60867 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Neurod1Q60867 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Neurod1Q60867 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Neurod1Q60867 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Neurod1Q60867 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Neurod1Q60867 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Neurod1Q60867 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Neurod1Q60867 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Neurod1Q60867 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Neurod1Q60867 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Neurod1Q60867 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Neurod1Q60867 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Neurod1Q60867 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Neurod1Q60867 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Neurod1Q60867 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Neurod1Q60867 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Neurod1Q60867 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Neurod1Q60867 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Neurod1Q60867 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Neurod1Q60867 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Neurod1Q60867 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Neurod1Q60867 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Neurod1Q60867 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Neurod1Q60867 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Neurod1Q60867 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Neurod1Q60867 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Neurod1Q60867 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Neurod1Q60867 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Neurod1Q60867 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Neurod1Q60867 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Neurod1Q60867 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Neurod1Q60867 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Neurod1Q60867 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Neurod1Q60867 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Neurod1Q60867 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Neurod1Q60867 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Neurod1Q60867 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Neurod1Q60867 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Neurod1Q60867 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Neurod1Q60867 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Neurod1Q60867 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Neurod1Q60867 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Neurod1Q60867 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Neurod1Q60867 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Neurod1Q60867 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Neurod1Q60867 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
Neurod1Q60867 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Neurod1Q60867 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Neurod1Q60867 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Neurod1Q60867 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Neurod1Q60867 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Neurod1Q60867 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Neurod1Q60867 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Neurod1Q60867 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Neurod1Q60867 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.32
Neurod1Q60867 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Neurod1Q60867 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Neurod1Q60867 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Neurod1Q60867 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Neurod1Q60867 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Neurod1Q60867 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Neurod1Q60867 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Neurod1Q60867 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Neurod1Q60867 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Neurod1Q60867 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Neurod1Q60867 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Neurod1Q60867 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Neurod1Q60867 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Neurod1Q60867 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Neurod1Q60867 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Neurod1Q60867 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Neurod1Q60867 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Neurod1Q60867 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Neurod1Q60867 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Neurod1Q60867 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Neurod1Q60867 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Neurod1Q60867 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Neurod1Q60867 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Neurod1Q60867 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Neurod1Q60867 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.8 ms