Protein–RNA interactions for Protein: Q60857

Slc6a4, Sodium-dependent serotonin transporter, mousemouse

Predictions only

Length 630 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc6a4Q60857 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Slc6a4Q60857 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Slc6a4Q60857 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Slc6a4Q60857 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Slc6a4Q60857 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Slc6a4Q60857 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Slc6a4Q60857 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Slc6a4Q60857 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Slc6a4Q60857 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Slc6a4Q60857 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Slc6a4Q60857 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Slc6a4Q60857 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Slc6a4Q60857 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Slc6a4Q60857 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Slc6a4Q60857 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Slc6a4Q60857 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Slc6a4Q60857 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Slc6a4Q60857 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Slc6a4Q60857 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Slc6a4Q60857 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Slc6a4Q60857 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Slc6a4Q60857 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Slc6a4Q60857 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Slc6a4Q60857 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Slc6a4Q60857 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Slc6a4Q60857 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Slc6a4Q60857 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Slc6a4Q60857 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Slc6a4Q60857 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Slc6a4Q60857 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Slc6a4Q60857 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Slc6a4Q60857 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Slc6a4Q60857 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Slc6a4Q60857 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Slc6a4Q60857 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Slc6a4Q60857 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Slc6a4Q60857 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Slc6a4Q60857 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Slc6a4Q60857 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Slc6a4Q60857 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Slc6a4Q60857 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Slc6a4Q60857 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Slc6a4Q60857 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Slc6a4Q60857 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Slc6a4Q60857 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Slc6a4Q60857 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Slc6a4Q60857 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Slc6a4Q60857 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Slc6a4Q60857 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Slc6a4Q60857 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Slc6a4Q60857 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Slc6a4Q60857 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Slc6a4Q60857 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Slc6a4Q60857 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Slc6a4Q60857 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Slc6a4Q60857 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Slc6a4Q60857 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Slc6a4Q60857 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Slc6a4Q60857 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Slc6a4Q60857 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Slc6a4Q60857 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Slc6a4Q60857 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Slc6a4Q60857 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Slc6a4Q60857 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Slc6a4Q60857 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Slc6a4Q60857 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Slc6a4Q60857 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Slc6a4Q60857 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Slc6a4Q60857 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Slc6a4Q60857 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Slc6a4Q60857 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Slc6a4Q60857 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Slc6a4Q60857 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Slc6a4Q60857 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC16.14■□□□□ 0.18
Slc6a4Q60857 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Slc6a4Q60857 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Slc6a4Q60857 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Slc6a4Q60857 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Slc6a4Q60857 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Slc6a4Q60857 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Slc6a4Q60857 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Slc6a4Q60857 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Slc6a4Q60857 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Slc6a4Q60857 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Slc6a4Q60857 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Slc6a4Q60857 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Slc6a4Q60857 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Slc6a4Q60857 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Slc6a4Q60857 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Slc6a4Q60857 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Slc6a4Q60857 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Slc6a4Q60857 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Slc6a4Q60857 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Slc6a4Q60857 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Slc6a4Q60857 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Slc6a4Q60857 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Slc6a4Q60857 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Slc6a4Q60857 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Slc6a4Q60857 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Slc6a4Q60857 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.2 ms