Protein–RNA interactions for Protein: Q60803

Traf3, TNF receptor-associated factor 3, mousemouse

Predictions only

Length 567 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Traf3Q60803 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Traf3Q60803 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Traf3Q60803 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Traf3Q60803 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Traf3Q60803 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Traf3Q60803 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Traf3Q60803 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Traf3Q60803 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Traf3Q60803 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Traf3Q60803 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Traf3Q60803 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Traf3Q60803 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Traf3Q60803 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Traf3Q60803 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Traf3Q60803 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Traf3Q60803 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Traf3Q60803 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Traf3Q60803 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Traf3Q60803 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Traf3Q60803 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Traf3Q60803 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Traf3Q60803 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Traf3Q60803 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Traf3Q60803 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Traf3Q60803 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Traf3Q60803 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Traf3Q60803 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Traf3Q60803 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Traf3Q60803 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Traf3Q60803 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Traf3Q60803 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Traf3Q60803 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Traf3Q60803 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Traf3Q60803 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Traf3Q60803 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Traf3Q60803 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Traf3Q60803 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Traf3Q60803 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Traf3Q60803 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Traf3Q60803 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Traf3Q60803 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Traf3Q60803 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Traf3Q60803 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Traf3Q60803 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Traf3Q60803 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Traf3Q60803 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Traf3Q60803 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Traf3Q60803 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Traf3Q60803 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Traf3Q60803 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Traf3Q60803 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Traf3Q60803 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Traf3Q60803 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Traf3Q60803 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Traf3Q60803 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Traf3Q60803 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Traf3Q60803 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Traf3Q60803 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Traf3Q60803 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Traf3Q60803 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Traf3Q60803 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Traf3Q60803 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Traf3Q60803 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Traf3Q60803 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Traf3Q60803 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Traf3Q60803 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Traf3Q60803 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Traf3Q60803 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Traf3Q60803 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Traf3Q60803 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Traf3Q60803 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Traf3Q60803 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Traf3Q60803 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Traf3Q60803 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Traf3Q60803 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Traf3Q60803 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Traf3Q60803 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Traf3Q60803 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Traf3Q60803 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Traf3Q60803 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Traf3Q60803 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Traf3Q60803 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Traf3Q60803 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Traf3Q60803 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Traf3Q60803 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Traf3Q60803 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Traf3Q60803 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Traf3Q60803 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Traf3Q60803 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Traf3Q60803 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Traf3Q60803 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Traf3Q60803 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Traf3Q60803 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Traf3Q60803 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Traf3Q60803 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Traf3Q60803 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Traf3Q60803 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Traf3Q60803 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Traf3Q60803 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Traf3Q60803 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50 ms