Protein–RNA interactions for Protein: Q60793

Klf4, Krueppel-like factor 4, mousemouse

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Length 483 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klf4Q60793 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Klf4Q60793 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Klf4Q60793 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Klf4Q60793 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Klf4Q60793 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Klf4Q60793 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Klf4Q60793 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Klf4Q60793 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Klf4Q60793 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Klf4Q60793 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Klf4Q60793 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Klf4Q60793 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Klf4Q60793 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Klf4Q60793 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Klf4Q60793 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Klf4Q60793 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Klf4Q60793 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Klf4Q60793 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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Klf4Q60793 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Klf4Q60793 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Klf4Q60793 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Klf4Q60793 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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Klf4Q60793 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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Klf4Q60793 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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Klf4Q60793 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Klf4Q60793 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Klf4Q60793 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Klf4Q60793 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Klf4Q60793 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Klf4Q60793 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Klf4Q60793 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
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Klf4Q60793 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Klf4Q60793 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Klf4Q60793 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Klf4Q60793 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Klf4Q60793 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Klf4Q60793 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Klf4Q60793 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Klf4Q60793 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
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Klf4Q60793 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Klf4Q60793 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Klf4Q60793 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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Klf4Q60793 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Klf4Q60793 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
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Klf4Q60793 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Klf4Q60793 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Klf4Q60793 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Klf4Q60793 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Klf4Q60793 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Klf4Q60793 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
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Klf4Q60793 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
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Klf4Q60793 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Klf4Q60793 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Klf4Q60793 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
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Klf4Q60793 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Klf4Q60793 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
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Klf4Q60793 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Klf4Q60793 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Klf4Q60793 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Klf4Q60793 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Klf4Q60793 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Klf4Q60793 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Klf4Q60793 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Klf4Q60793 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Klf4Q60793 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Klf4Q60793 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Klf4Q60793 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Klf4Q60793 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
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