Protein–RNA interactions for Protein: Q60765

Atf3, Cyclic AMP-dependent transcription factor ATF-3, mousemouse

Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atf3Q60765 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Atf3Q60765 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Atf3Q60765 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Atf3Q60765 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Atf3Q60765 Clnkos-201ENSMUST00000114080 439 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Atf3Q60765 Rab4a-201ENSMUST00000117702 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Atf3Q60765 2700012I20Rik-201ENSMUST00000180525 684 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Atf3Q60765 Mir7684-201ENSMUST00000183858 60 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
Atf3Q60765 Gm36536-201ENSMUST00000194241 959 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Atf3Q60765 CT030684.1-201ENSMUST00000227292 914 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
Atf3Q60765 Eef1akmt2-201ENSMUST00000033257 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Atf3Q60765 Hes5-201ENSMUST00000049621 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Atf3Q60765 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Atf3Q60765 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Atf3Q60765 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Atf3Q60765 Chp2-201ENSMUST00000033152 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Atf3Q60765 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Atf3Q60765 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Atf3Q60765 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Atf3Q60765 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Atf3Q60765 Osr2-201ENSMUST00000022952 1724 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Atf3Q60765 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Atf3Q60765 Gm6415-201ENSMUST00000118488 348 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Atf3Q60765 Kxd1-204ENSMUST00000121623 884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Atf3Q60765 4930478K11Rik-201ENSMUST00000181875 715 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Atf3Q60765 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Atf3Q60765 Mt1-201ENSMUST00000034215 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Atf3Q60765 Kxd1-201ENSMUST00000093456 1216 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Atf3Q60765 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Atf3Q60765 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Atf3Q60765 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Atf3Q60765 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Atf3Q60765 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Atf3Q60765 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Atf3Q60765 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Atf3Q60765 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Atf3Q60765 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Atf3Q60765 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Atf3Q60765 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Atf3Q60765 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Atf3Q60765 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Atf3Q60765 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Atf3Q60765 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Atf3Q60765 4930417O22Rik-201ENSMUST00000123249 1184 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Atf3Q60765 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Atf3Q60765 Lamtor3-201ENSMUST00000168345 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Atf3Q60765 Mir99ahg-211ENSMUST00000183099 1189 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Atf3Q60765 Gm38294-201ENSMUST00000192831 381 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Atf3Q60765 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Atf3Q60765 Prg3-201ENSMUST00000028466 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Atf3Q60765 Pemt-201ENSMUST00000000310 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Atf3Q60765 Rps27l-201ENSMUST00000040917 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Atf3Q60765 Gm5519-201ENSMUST00000042061 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Atf3Q60765 Atad3aos-201ENSMUST00000067628 971 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Atf3Q60765 Gm4559-201ENSMUST00000080669 600 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Atf3Q60765 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Atf3Q60765 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Atf3Q60765 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Atf3Q60765 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Atf3Q60765 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Atf3Q60765 Coq6-203ENSMUST00000110278 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Atf3Q60765 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Atf3Q60765 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Atf3Q60765 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Atf3Q60765 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Atf3Q60765 Metrnl-202ENSMUST00000106089 1101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Atf3Q60765 Gm13453-201ENSMUST00000118708 357 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Atf3Q60765 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Atf3Q60765 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Atf3Q60765 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Atf3Q60765 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Atf3Q60765 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Atf3Q60765 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Atf3Q60765 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Atf3Q60765 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Atf3Q60765 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Atf3Q60765 Trappc2-203ENSMUST00000116495 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Atf3Q60765 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Atf3Q60765 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Atf3Q60765 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Atf3Q60765 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Atf3Q60765 B9d1-201ENSMUST00000102657 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Atf3Q60765 Rpl32-202ENSMUST00000203816 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Atf3Q60765 Gm7653-201ENSMUST00000214567 508 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Atf3Q60765 Ndufs6-204ENSMUST00000223293 757 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Atf3Q60765 Cript-201ENSMUST00000024959 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Atf3Q60765 Aip-201ENSMUST00000025767 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Atf3Q60765 Gcsh-201ENSMUST00000040484 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Atf3Q60765 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Atf3Q60765 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Atf3Q60765 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Atf3Q60765 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Atf3Q60765 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Atf3Q60765 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Atf3Q60765 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Atf3Q60765 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Atf3Q60765 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Atf3Q60765 Gm29520-201ENSMUST00000191209 1067 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Atf3Q60765 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Atf3Q60765 Gm5771-201ENSMUST00000049079 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.1 ms