Protein–RNA interactions for Protein: Q60714

Slc27a1, Long-chain fatty acid transport protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 646 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc27a1Q60714 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Slc27a1Q60714 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Slc27a1Q60714 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Slc27a1Q60714 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Slc27a1Q60714 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Slc27a1Q60714 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Slc27a1Q60714 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Slc27a1Q60714 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Slc27a1Q60714 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Slc27a1Q60714 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Slc27a1Q60714 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Slc27a1Q60714 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Slc27a1Q60714 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Slc27a1Q60714 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Slc27a1Q60714 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Slc27a1Q60714 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Slc27a1Q60714 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Slc27a1Q60714 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Slc27a1Q60714 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Slc27a1Q60714 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Slc27a1Q60714 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Slc27a1Q60714 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Slc27a1Q60714 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Slc27a1Q60714 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Slc27a1Q60714 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Slc27a1Q60714 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Slc27a1Q60714 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Slc27a1Q60714 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Slc27a1Q60714 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Slc27a1Q60714 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Slc27a1Q60714 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Slc27a1Q60714 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Slc27a1Q60714 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Slc27a1Q60714 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Slc27a1Q60714 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Slc27a1Q60714 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Slc27a1Q60714 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Slc27a1Q60714 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Slc27a1Q60714 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Slc27a1Q60714 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Slc27a1Q60714 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Slc27a1Q60714 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Slc27a1Q60714 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Slc27a1Q60714 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Slc27a1Q60714 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Slc27a1Q60714 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Slc27a1Q60714 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Slc27a1Q60714 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Slc27a1Q60714 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Slc27a1Q60714 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Slc27a1Q60714 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Slc27a1Q60714 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Slc27a1Q60714 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Slc27a1Q60714 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Slc27a1Q60714 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Slc27a1Q60714 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Slc27a1Q60714 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Slc27a1Q60714 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Slc27a1Q60714 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Slc27a1Q60714 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Slc27a1Q60714 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Slc27a1Q60714 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Slc27a1Q60714 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Slc27a1Q60714 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Slc27a1Q60714 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Slc27a1Q60714 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Slc27a1Q60714 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Slc27a1Q60714 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Slc27a1Q60714 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Slc27a1Q60714 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Slc27a1Q60714 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Slc27a1Q60714 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Slc27a1Q60714 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Slc27a1Q60714 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Slc27a1Q60714 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Slc27a1Q60714 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Slc27a1Q60714 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Slc27a1Q60714 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Slc27a1Q60714 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Slc27a1Q60714 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Slc27a1Q60714 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Slc27a1Q60714 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Slc27a1Q60714 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Slc27a1Q60714 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Slc27a1Q60714 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Slc27a1Q60714 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Slc27a1Q60714 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Slc27a1Q60714 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Slc27a1Q60714 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Slc27a1Q60714 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Slc27a1Q60714 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Slc27a1Q60714 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Slc27a1Q60714 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Slc27a1Q60714 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Slc27a1Q60714 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Slc27a1Q60714 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Slc27a1Q60714 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Slc27a1Q60714 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Slc27a1Q60714 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Slc27a1Q60714 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26 ms