Protein–RNA interactions for Protein: Q60668

Hnrnpd, Heterogeneous nuclear ribonucleoprotein D0, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 355 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HnrnpdQ60668 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HnrnpdQ60668 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
HnrnpdQ60668 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HnrnpdQ60668 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
HnrnpdQ60668 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
HnrnpdQ60668 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
HnrnpdQ60668 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HnrnpdQ60668 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
HnrnpdQ60668 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
HnrnpdQ60668 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HnrnpdQ60668 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HnrnpdQ60668 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HnrnpdQ60668 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HnrnpdQ60668 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HnrnpdQ60668 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HnrnpdQ60668 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HnrnpdQ60668 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HnrnpdQ60668 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
HnrnpdQ60668 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HnrnpdQ60668 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HnrnpdQ60668 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
HnrnpdQ60668 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
HnrnpdQ60668 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
HnrnpdQ60668 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
HnrnpdQ60668 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
HnrnpdQ60668 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
HnrnpdQ60668 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
HnrnpdQ60668 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
HnrnpdQ60668 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
HnrnpdQ60668 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
HnrnpdQ60668 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
HnrnpdQ60668 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
HnrnpdQ60668 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
HnrnpdQ60668 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
HnrnpdQ60668 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
HnrnpdQ60668 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
HnrnpdQ60668 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
HnrnpdQ60668 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
HnrnpdQ60668 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
HnrnpdQ60668 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.22
HnrnpdQ60668 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
HnrnpdQ60668 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
HnrnpdQ60668 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
HnrnpdQ60668 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
HnrnpdQ60668 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
HnrnpdQ60668 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
HnrnpdQ60668 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
HnrnpdQ60668 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
HnrnpdQ60668 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
HnrnpdQ60668 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
HnrnpdQ60668 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
HnrnpdQ60668 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
HnrnpdQ60668 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
HnrnpdQ60668 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
HnrnpdQ60668 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
HnrnpdQ60668 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
HnrnpdQ60668 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
HnrnpdQ60668 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
HnrnpdQ60668 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
HnrnpdQ60668 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
HnrnpdQ60668 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HnrnpdQ60668 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HnrnpdQ60668 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HnrnpdQ60668 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
HnrnpdQ60668 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HnrnpdQ60668 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
HnrnpdQ60668 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HnrnpdQ60668 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HnrnpdQ60668 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
HnrnpdQ60668 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HnrnpdQ60668 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HnrnpdQ60668 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
HnrnpdQ60668 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HnrnpdQ60668 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HnrnpdQ60668 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HnrnpdQ60668 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
HnrnpdQ60668 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HnrnpdQ60668 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HnrnpdQ60668 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HnrnpdQ60668 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HnrnpdQ60668 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
HnrnpdQ60668 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
HnrnpdQ60668 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HnrnpdQ60668 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HnrnpdQ60668 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HnrnpdQ60668 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HnrnpdQ60668 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HnrnpdQ60668 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HnrnpdQ60668 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HnrnpdQ60668 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HnrnpdQ60668 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HnrnpdQ60668 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HnrnpdQ60668 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HnrnpdQ60668 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HnrnpdQ60668 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HnrnpdQ60668 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HnrnpdQ60668 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HnrnpdQ60668 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HnrnpdQ60668 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HnrnpdQ60668 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.9 ms