Protein–RNA interactions for Protein: Q60598

Cttn, Src substrate cortactin, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 546 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CttnQ60598 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CttnQ60598 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CttnQ60598 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CttnQ60598 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
CttnQ60598 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CttnQ60598 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CttnQ60598 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CttnQ60598 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CttnQ60598 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CttnQ60598 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CttnQ60598 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CttnQ60598 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CttnQ60598 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CttnQ60598 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CttnQ60598 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CttnQ60598 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CttnQ60598 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CttnQ60598 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CttnQ60598 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CttnQ60598 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CttnQ60598 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CttnQ60598 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CttnQ60598 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CttnQ60598 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CttnQ60598 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CttnQ60598 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CttnQ60598 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CttnQ60598 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CttnQ60598 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CttnQ60598 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CttnQ60598 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CttnQ60598 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CttnQ60598 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CttnQ60598 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CttnQ60598 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CttnQ60598 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CttnQ60598 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CttnQ60598 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CttnQ60598 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CttnQ60598 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CttnQ60598 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CttnQ60598 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CttnQ60598 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CttnQ60598 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CttnQ60598 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CttnQ60598 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CttnQ60598 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CttnQ60598 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CttnQ60598 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CttnQ60598 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CttnQ60598 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CttnQ60598 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CttnQ60598 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CttnQ60598 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CttnQ60598 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CttnQ60598 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CttnQ60598 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CttnQ60598 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CttnQ60598 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CttnQ60598 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CttnQ60598 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CttnQ60598 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CttnQ60598 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CttnQ60598 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CttnQ60598 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CttnQ60598 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CttnQ60598 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CttnQ60598 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CttnQ60598 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CttnQ60598 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CttnQ60598 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CttnQ60598 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CttnQ60598 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CttnQ60598 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CttnQ60598 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CttnQ60598 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CttnQ60598 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CttnQ60598 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
CttnQ60598 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
CttnQ60598 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
CttnQ60598 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC16.58■□□□□ 0.25
CttnQ60598 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
CttnQ60598 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
CttnQ60598 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CttnQ60598 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
CttnQ60598 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CttnQ60598 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CttnQ60598 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CttnQ60598 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
CttnQ60598 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
CttnQ60598 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CttnQ60598 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
CttnQ60598 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CttnQ60598 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CttnQ60598 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CttnQ60598 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
CttnQ60598 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CttnQ60598 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
CttnQ60598 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CttnQ60598 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.9 ms