Protein–RNA interactions for Protein: Q60520

Sin3a, Paired amphipathic helix protein Sin3a, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,274 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sin3aQ60520 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Sin3aQ60520 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Sin3aQ60520 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Sin3aQ60520 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Sin3aQ60520 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Sin3aQ60520 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Sin3aQ60520 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Sin3aQ60520 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Sin3aQ60520 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Sin3aQ60520 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Sin3aQ60520 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Sin3aQ60520 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Sin3aQ60520 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Sin3aQ60520 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Sin3aQ60520 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Sin3aQ60520 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Sin3aQ60520 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Sin3aQ60520 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Sin3aQ60520 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Sin3aQ60520 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Sin3aQ60520 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Sin3aQ60520 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Sin3aQ60520 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Sin3aQ60520 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Sin3aQ60520 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Sin3aQ60520 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Sin3aQ60520 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Sin3aQ60520 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Sin3aQ60520 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Sin3aQ60520 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Sin3aQ60520 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Sin3aQ60520 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Sin3aQ60520 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Sin3aQ60520 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Sin3aQ60520 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Sin3aQ60520 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Sin3aQ60520 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Sin3aQ60520 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Sin3aQ60520 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Sin3aQ60520 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Sin3aQ60520 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Sin3aQ60520 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Sin3aQ60520 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Sin3aQ60520 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Sin3aQ60520 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Sin3aQ60520 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Sin3aQ60520 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Sin3aQ60520 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Sin3aQ60520 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Sin3aQ60520 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Sin3aQ60520 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Sin3aQ60520 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Sin3aQ60520 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Sin3aQ60520 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Sin3aQ60520 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Sin3aQ60520 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Sin3aQ60520 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Sin3aQ60520 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Sin3aQ60520 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Sin3aQ60520 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Sin3aQ60520 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Sin3aQ60520 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Sin3aQ60520 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Sin3aQ60520 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
Sin3aQ60520 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Sin3aQ60520 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Sin3aQ60520 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Sin3aQ60520 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Sin3aQ60520 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Sin3aQ60520 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Sin3aQ60520 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Sin3aQ60520 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Sin3aQ60520 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
Sin3aQ60520 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Sin3aQ60520 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Sin3aQ60520 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Sin3aQ60520 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Sin3aQ60520 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Sin3aQ60520 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Sin3aQ60520 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Sin3aQ60520 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Sin3aQ60520 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Sin3aQ60520 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Sin3aQ60520 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Sin3aQ60520 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Sin3aQ60520 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Sin3aQ60520 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Sin3aQ60520 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Sin3aQ60520 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Sin3aQ60520 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Sin3aQ60520 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Sin3aQ60520 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Sin3aQ60520 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Sin3aQ60520 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Sin3aQ60520 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Sin3aQ60520 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Sin3aQ60520 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Sin3aQ60520 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Sin3aQ60520 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Sin3aQ60520 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28 ms