Protein–RNA interactions for Protein: Q5SWD9

Tsr1, Pre-rRNA-processing protein TSR1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 803 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tsr1Q5SWD9 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Tsr1Q5SWD9 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Tsr1Q5SWD9 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Tsr1Q5SWD9 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Tsr1Q5SWD9 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Tsr1Q5SWD9 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Tsr1Q5SWD9 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Tsr1Q5SWD9 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Tsr1Q5SWD9 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tsr1Q5SWD9 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tsr1Q5SWD9 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tsr1Q5SWD9 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tsr1Q5SWD9 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tsr1Q5SWD9 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tsr1Q5SWD9 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tsr1Q5SWD9 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tsr1Q5SWD9 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tsr1Q5SWD9 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tsr1Q5SWD9 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tsr1Q5SWD9 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tsr1Q5SWD9 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tsr1Q5SWD9 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tsr1Q5SWD9 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tsr1Q5SWD9 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Tsr1Q5SWD9 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tsr1Q5SWD9 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tsr1Q5SWD9 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tsr1Q5SWD9 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tsr1Q5SWD9 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Tsr1Q5SWD9 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tsr1Q5SWD9 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tsr1Q5SWD9 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tsr1Q5SWD9 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tsr1Q5SWD9 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tsr1Q5SWD9 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tsr1Q5SWD9 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Tsr1Q5SWD9 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tsr1Q5SWD9 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tsr1Q5SWD9 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tsr1Q5SWD9 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tsr1Q5SWD9 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tsr1Q5SWD9 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tsr1Q5SWD9 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tsr1Q5SWD9 4930433J02Rik-201ENSMUST00000194719 1386 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Tsr1Q5SWD9 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Tsr1Q5SWD9 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Tsr1Q5SWD9 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Tsr1Q5SWD9 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Tsr1Q5SWD9 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Tsr1Q5SWD9 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Tsr1Q5SWD9 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Tsr1Q5SWD9 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Tsr1Q5SWD9 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Tsr1Q5SWD9 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Tsr1Q5SWD9 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Tsr1Q5SWD9 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Tsr1Q5SWD9 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Tsr1Q5SWD9 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Tsr1Q5SWD9 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Tsr1Q5SWD9 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Tsr1Q5SWD9 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Tsr1Q5SWD9 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Tsr1Q5SWD9 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Tsr1Q5SWD9 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Tsr1Q5SWD9 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Tsr1Q5SWD9 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Tsr1Q5SWD9 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Tsr1Q5SWD9 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Tsr1Q5SWD9 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Tsr1Q5SWD9 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Tsr1Q5SWD9 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Tsr1Q5SWD9 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tsr1Q5SWD9 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tsr1Q5SWD9 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tsr1Q5SWD9 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tsr1Q5SWD9 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tsr1Q5SWD9 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tsr1Q5SWD9 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tsr1Q5SWD9 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tsr1Q5SWD9 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tsr1Q5SWD9 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tsr1Q5SWD9 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tsr1Q5SWD9 Gm8369-204ENSMUST00000188633 1227 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tsr1Q5SWD9 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tsr1Q5SWD9 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tsr1Q5SWD9 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tsr1Q5SWD9 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tsr1Q5SWD9 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tsr1Q5SWD9 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tsr1Q5SWD9 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Tsr1Q5SWD9 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tsr1Q5SWD9 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tsr1Q5SWD9 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tsr1Q5SWD9 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tsr1Q5SWD9 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tsr1Q5SWD9 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Tsr1Q5SWD9 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tsr1Q5SWD9 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tsr1Q5SWD9 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tsr1Q5SWD9 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.5 ms