Protein–RNA interactions for Protein: Q5SV66

Ccdc42, Coiled-coil domain-containing protein 42, mousemouse

Predictions only

Length 316 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc42Q5SV66 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ccdc42Q5SV66 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ccdc42Q5SV66 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ccdc42Q5SV66 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ccdc42Q5SV66 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ccdc42Q5SV66 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ccdc42Q5SV66 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ccdc42Q5SV66 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ccdc42Q5SV66 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ccdc42Q5SV66 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ccdc42Q5SV66 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ccdc42Q5SV66 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ccdc42Q5SV66 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ccdc42Q5SV66 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ccdc42Q5SV66 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Ccdc42Q5SV66 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ccdc42Q5SV66 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ccdc42Q5SV66 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ccdc42Q5SV66 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ccdc42Q5SV66 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ccdc42Q5SV66 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ccdc42Q5SV66 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ccdc42Q5SV66 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ccdc42Q5SV66 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ccdc42Q5SV66 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ccdc42Q5SV66 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccdc42Q5SV66 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccdc42Q5SV66 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccdc42Q5SV66 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccdc42Q5SV66 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccdc42Q5SV66 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccdc42Q5SV66 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccdc42Q5SV66 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccdc42Q5SV66 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccdc42Q5SV66 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccdc42Q5SV66 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccdc42Q5SV66 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccdc42Q5SV66 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccdc42Q5SV66 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccdc42Q5SV66 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccdc42Q5SV66 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccdc42Q5SV66 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccdc42Q5SV66 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccdc42Q5SV66 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccdc42Q5SV66 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccdc42Q5SV66 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccdc42Q5SV66 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccdc42Q5SV66 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccdc42Q5SV66 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccdc42Q5SV66 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccdc42Q5SV66 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccdc42Q5SV66 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccdc42Q5SV66 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccdc42Q5SV66 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccdc42Q5SV66 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccdc42Q5SV66 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccdc42Q5SV66 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccdc42Q5SV66 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccdc42Q5SV66 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccdc42Q5SV66 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccdc42Q5SV66 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccdc42Q5SV66 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccdc42Q5SV66 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Ccdc42Q5SV66 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Ccdc42Q5SV66 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Ccdc42Q5SV66 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Ccdc42Q5SV66 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Ccdc42Q5SV66 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Ccdc42Q5SV66 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ccdc42Q5SV66 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ccdc42Q5SV66 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ccdc42Q5SV66 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ccdc42Q5SV66 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ccdc42Q5SV66 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ccdc42Q5SV66 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Ccdc42Q5SV66 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ccdc42Q5SV66 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ccdc42Q5SV66 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ccdc42Q5SV66 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ccdc42Q5SV66 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ccdc42Q5SV66 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ccdc42Q5SV66 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ccdc42Q5SV66 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ccdc42Q5SV66 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ccdc42Q5SV66 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ccdc42Q5SV66 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ccdc42Q5SV66 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ccdc42Q5SV66 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ccdc42Q5SV66 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ccdc42Q5SV66 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ccdc42Q5SV66 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ccdc42Q5SV66 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ccdc42Q5SV66 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ccdc42Q5SV66 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ccdc42Q5SV66 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ccdc42Q5SV66 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ccdc42Q5SV66 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ccdc42Q5SV66 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ccdc42Q5SV66 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ccdc42Q5SV66 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.9 ms