Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSI6

Utp18, U3 small nucleolar RNA-associated protein 18 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 552 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Utp18Q5SSI6 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Utp18Q5SSI6 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Utp18Q5SSI6 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Utp18Q5SSI6 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Utp18Q5SSI6 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Utp18Q5SSI6 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Utp18Q5SSI6 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Utp18Q5SSI6 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Utp18Q5SSI6 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Utp18Q5SSI6 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Utp18Q5SSI6 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Utp18Q5SSI6 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Utp18Q5SSI6 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Utp18Q5SSI6 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Utp18Q5SSI6 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Utp18Q5SSI6 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Utp18Q5SSI6 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Utp18Q5SSI6 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Utp18Q5SSI6 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Utp18Q5SSI6 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Utp18Q5SSI6 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Utp18Q5SSI6 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Utp18Q5SSI6 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Utp18Q5SSI6 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Utp18Q5SSI6 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Utp18Q5SSI6 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Utp18Q5SSI6 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Utp18Q5SSI6 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Utp18Q5SSI6 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Utp18Q5SSI6 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Utp18Q5SSI6 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Utp18Q5SSI6 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Utp18Q5SSI6 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Utp18Q5SSI6 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Utp18Q5SSI6 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Utp18Q5SSI6 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Utp18Q5SSI6 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Utp18Q5SSI6 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Utp18Q5SSI6 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Utp18Q5SSI6 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Utp18Q5SSI6 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Utp18Q5SSI6 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Utp18Q5SSI6 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Utp18Q5SSI6 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Utp18Q5SSI6 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Utp18Q5SSI6 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Utp18Q5SSI6 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Utp18Q5SSI6 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Utp18Q5SSI6 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Utp18Q5SSI6 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Utp18Q5SSI6 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Utp18Q5SSI6 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Utp18Q5SSI6 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Utp18Q5SSI6 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Utp18Q5SSI6 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Utp18Q5SSI6 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Utp18Q5SSI6 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Utp18Q5SSI6 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Utp18Q5SSI6 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Utp18Q5SSI6 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Utp18Q5SSI6 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Utp18Q5SSI6 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Utp18Q5SSI6 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Utp18Q5SSI6 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Utp18Q5SSI6 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Utp18Q5SSI6 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Utp18Q5SSI6 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Utp18Q5SSI6 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Utp18Q5SSI6 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Utp18Q5SSI6 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Utp18Q5SSI6 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Utp18Q5SSI6 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Utp18Q5SSI6 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Utp18Q5SSI6 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Utp18Q5SSI6 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Utp18Q5SSI6 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Utp18Q5SSI6 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Utp18Q5SSI6 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Utp18Q5SSI6 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Utp18Q5SSI6 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Utp18Q5SSI6 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Utp18Q5SSI6 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Utp18Q5SSI6 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Utp18Q5SSI6 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Utp18Q5SSI6 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Utp18Q5SSI6 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Utp18Q5SSI6 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Utp18Q5SSI6 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Utp18Q5SSI6 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Utp18Q5SSI6 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Utp18Q5SSI6 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Utp18Q5SSI6 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Utp18Q5SSI6 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Utp18Q5SSI6 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Utp18Q5SSI6 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Utp18Q5SSI6 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Utp18Q5SSI6 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Utp18Q5SSI6 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Utp18Q5SSI6 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Utp18Q5SSI6 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.9 ms