Protein–RNA interactions for Protein: Q5SNZ0

Ccdc88a, Girdin, mousemouse

Predictions only

Length 1,873 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc88aQ5SNZ0 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccdc88aQ5SNZ0 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccdc88aQ5SNZ0 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccdc88aQ5SNZ0 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc88aQ5SNZ0 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc88aQ5SNZ0 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc88aQ5SNZ0 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc88aQ5SNZ0 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc88aQ5SNZ0 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc88aQ5SNZ0 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc88aQ5SNZ0 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc88aQ5SNZ0 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc88aQ5SNZ0 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc88aQ5SNZ0 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc88aQ5SNZ0 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc88aQ5SNZ0 Arhgef33-209ENSMUST00000225223 714 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc88aQ5SNZ0 Alkbh7-201ENSMUST00000002737 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm8396-201ENSMUST00000057361 823 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc88aQ5SNZ0 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc88aQ5SNZ0 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc88aQ5SNZ0 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc88aQ5SNZ0 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc88aQ5SNZ0 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ccdc88aQ5SNZ0 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ccdc88aQ5SNZ0 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ccdc88aQ5SNZ0 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ccdc88aQ5SNZ0 Tmem38a-203ENSMUST00000212763 882 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ccdc88aQ5SNZ0 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ccdc88aQ5SNZ0 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ccdc88aQ5SNZ0 Erich4-201ENSMUST00000098663 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ccdc88aQ5SNZ0 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ccdc88aQ5SNZ0 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ccdc88aQ5SNZ0 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ccdc88aQ5SNZ0 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc88aQ5SNZ0 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc88aQ5SNZ0 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc88aQ5SNZ0 Sbk2-201ENSMUST00000032598 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc88aQ5SNZ0 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc88aQ5SNZ0 Folr1-204ENSMUST00000106985 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc88aQ5SNZ0 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc88aQ5SNZ0 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc88aQ5SNZ0 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc88aQ5SNZ0 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc88aQ5SNZ0 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc88aQ5SNZ0 Haghl-207ENSMUST00000140738 1194 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc88aQ5SNZ0 Tgfb1i1-203ENSMUST00000163609 1053 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc88aQ5SNZ0 Zdhhc23-202ENSMUST00000165648 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc88aQ5SNZ0 Skiv2l-ps1-201ENSMUST00000173935 658 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm35911-201ENSMUST00000198837 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc88aQ5SNZ0 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc88aQ5SNZ0 Gtf2e2-201ENSMUST00000167264 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc88aQ5SNZ0 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc88aQ5SNZ0 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc88aQ5SNZ0 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc88aQ5SNZ0 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc88aQ5SNZ0 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc88aQ5SNZ0 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc88aQ5SNZ0 Runx2os2-201ENSMUST00000161664 818 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc88aQ5SNZ0 Cebpzos-202ENSMUST00000180077 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc88aQ5SNZ0 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc88aQ5SNZ0 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc88aQ5SNZ0 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc88aQ5SNZ0 Krtap19-4-201ENSMUST00000051103 304 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc88aQ5SNZ0 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc88aQ5SNZ0 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc88aQ5SNZ0 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc88aQ5SNZ0 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc88aQ5SNZ0 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc88aQ5SNZ0 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc88aQ5SNZ0 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc88aQ5SNZ0 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc88aQ5SNZ0 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc88aQ5SNZ0 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc88aQ5SNZ0 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc88aQ5SNZ0 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc88aQ5SNZ0 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc88aQ5SNZ0 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc88aQ5SNZ0 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc88aQ5SNZ0 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc88aQ5SNZ0 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc88aQ5SNZ0 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc88aQ5SNZ0 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc88aQ5SNZ0 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc88aQ5SNZ0 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc88aQ5SNZ0 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc88aQ5SNZ0 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc88aQ5SNZ0 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc88aQ5SNZ0 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc88aQ5SNZ0 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc88aQ5SNZ0 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm5626-201ENSMUST00000222151 1058 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc88aQ5SNZ0 Pecr-201ENSMUST00000027381 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.3 ms