Protein–RNA interactions for Protein: Q5S248

Tmprss11e, Transmembrane protease serine 11E, mousemouse

Predictions only

Length 423 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmprss11eQ5S248 Gm25086-201ENSMUST00000179931 110 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Tmprss11eQ5S248 Gm23243-201ENSMUST00000180047 110 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Tmprss11eQ5S248 Gm24659-201ENSMUST00000180212 110 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Tmprss11eQ5S248 Gm24169-201ENSMUST00000180244 110 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Tmprss11eQ5S248 Gm23689-201ENSMUST00000180354 110 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Tmprss11eQ5S248 Gm27359-201ENSMUST00000184153 110 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Tmprss11eQ5S248 Gm27785-201ENSMUST00000184268 110 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Tmprss11eQ5S248 Gm27466-201ENSMUST00000184396 110 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Tmprss11eQ5S248 Gm27703-201ENSMUST00000184836 110 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Tmprss11eQ5S248 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tmprss11eQ5S248 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tmprss11eQ5S248 Cyhr1-201ENSMUST00000066677 1163 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tmprss11eQ5S248 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tmprss11eQ5S248 Lce3e-201ENSMUST00000098886 607 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tmprss11eQ5S248 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Tmprss11eQ5S248 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Tmprss11eQ5S248 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Tmprss11eQ5S248 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Tmprss11eQ5S248 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Tmprss11eQ5S248 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Tmprss11eQ5S248 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Tmprss11eQ5S248 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tmprss11eQ5S248 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tmprss11eQ5S248 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tmprss11eQ5S248 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tmprss11eQ5S248 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tmprss11eQ5S248 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tmprss11eQ5S248 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tmprss11eQ5S248 Tnfrsf13b-202ENSMUST00000101103 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tmprss11eQ5S248 Mrto4-202ENSMUST00000102503 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tmprss11eQ5S248 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tmprss11eQ5S248 Ercc8-202ENSMUST00000120672 1144 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tmprss11eQ5S248 Zfp715-201ENSMUST00000012796 907 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tmprss11eQ5S248 Gm17251-201ENSMUST00000170103 925 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tmprss11eQ5S248 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Tmprss11eQ5S248 Gm35911-201ENSMUST00000198837 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tmprss11eQ5S248 Tmem86b-204ENSMUST00000206610 522 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tmprss11eQ5S248 Gm18057-201ENSMUST00000208220 503 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Tmprss11eQ5S248 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tmprss11eQ5S248 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tmprss11eQ5S248 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tmprss11eQ5S248 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tmprss11eQ5S248 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tmprss11eQ5S248 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tmprss11eQ5S248 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tmprss11eQ5S248 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tmprss11eQ5S248 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tmprss11eQ5S248 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tmprss11eQ5S248 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Tmprss11eQ5S248 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tmprss11eQ5S248 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tmprss11eQ5S248 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tmprss11eQ5S248 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Tmprss11eQ5S248 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tmprss11eQ5S248 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Tmprss11eQ5S248 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Tmprss11eQ5S248 Gm11937-201ENSMUST00000076478 396 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
Tmprss11eQ5S248 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tmprss11eQ5S248 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tmprss11eQ5S248 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
Tmprss11eQ5S248 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tmprss11eQ5S248 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Tmprss11eQ5S248 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tmprss11eQ5S248 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tmprss11eQ5S248 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tmprss11eQ5S248 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tmprss11eQ5S248 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tmprss11eQ5S248 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tmprss11eQ5S248 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tmprss11eQ5S248 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tmprss11eQ5S248 Kir3dl1-201ENSMUST00000113104 1031 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tmprss11eQ5S248 Xrcc2-204ENSMUST00000134972 464 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tmprss11eQ5S248 Gm14104-201ENSMUST00000135990 356 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tmprss11eQ5S248 Trip6-203ENSMUST00000199121 366 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tmprss11eQ5S248 Rps10-201ENSMUST00000025052 519 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tmprss11eQ5S248 Syce1l-201ENSMUST00000034219 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tmprss11eQ5S248 Syce1l-202ENSMUST00000095173 791 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tmprss11eQ5S248 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tmprss11eQ5S248 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tmprss11eQ5S248 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tmprss11eQ5S248 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tmprss11eQ5S248 Ttll9-202ENSMUST00000103155 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tmprss11eQ5S248 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tmprss11eQ5S248 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tmprss11eQ5S248 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tmprss11eQ5S248 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tmprss11eQ5S248 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tmprss11eQ5S248 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tmprss11eQ5S248 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tmprss11eQ5S248 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tmprss11eQ5S248 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tmprss11eQ5S248 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Tmprss11eQ5S248 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tmprss11eQ5S248 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tmprss11eQ5S248 Eef1akmt4-201ENSMUST00000115522 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tmprss11eQ5S248 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Tmprss11eQ5S248 Gm11515-201ENSMUST00000150818 701 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tmprss11eQ5S248 Klrg2-202ENSMUST00000201345 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tmprss11eQ5S248 AC159635.2-201ENSMUST00000223092 817 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tmprss11eQ5S248 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.9 ms