Protein–RNA interactions for Protein: Q5NCC9

Trim58, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM58, mousemouse

Predictions only

Length 485 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim58Q5NCC9 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Trim58Q5NCC9 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Trim58Q5NCC9 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Trim58Q5NCC9 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Trim58Q5NCC9 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Trim58Q5NCC9 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Trim58Q5NCC9 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Trim58Q5NCC9 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Trim58Q5NCC9 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Trim58Q5NCC9 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Trim58Q5NCC9 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Trim58Q5NCC9 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Trim58Q5NCC9 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Trim58Q5NCC9 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Trim58Q5NCC9 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Trim58Q5NCC9 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Trim58Q5NCC9 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Trim58Q5NCC9 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Trim58Q5NCC9 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Trim58Q5NCC9 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Trim58Q5NCC9 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Trim58Q5NCC9 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Trim58Q5NCC9 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Trim58Q5NCC9 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
Trim58Q5NCC9 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
Trim58Q5NCC9 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Trim58Q5NCC9 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC20■□□□□ 0.79
Trim58Q5NCC9 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC20■□□□□ 0.79
Trim58Q5NCC9 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Trim58Q5NCC9 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC20■□□□□ 0.79
Trim58Q5NCC9 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Trim58Q5NCC9 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Trim58Q5NCC9 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Trim58Q5NCC9 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Trim58Q5NCC9 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Trim58Q5NCC9 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Trim58Q5NCC9 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
Trim58Q5NCC9 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Trim58Q5NCC9 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Trim58Q5NCC9 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Trim58Q5NCC9 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Trim58Q5NCC9 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Trim58Q5NCC9 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Trim58Q5NCC9 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Trim58Q5NCC9 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Trim58Q5NCC9 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Trim58Q5NCC9 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Trim58Q5NCC9 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Trim58Q5NCC9 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Trim58Q5NCC9 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Trim58Q5NCC9 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Trim58Q5NCC9 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Trim58Q5NCC9 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Trim58Q5NCC9 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Trim58Q5NCC9 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Trim58Q5NCC9 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Trim58Q5NCC9 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Trim58Q5NCC9 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Trim58Q5NCC9 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Trim58Q5NCC9 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Trim58Q5NCC9 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Trim58Q5NCC9 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Trim58Q5NCC9 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
Trim58Q5NCC9 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Trim58Q5NCC9 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Trim58Q5NCC9 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Trim58Q5NCC9 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Trim58Q5NCC9 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
Trim58Q5NCC9 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Trim58Q5NCC9 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Trim58Q5NCC9 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Trim58Q5NCC9 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Trim58Q5NCC9 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Trim58Q5NCC9 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Trim58Q5NCC9 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
Trim58Q5NCC9 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Trim58Q5NCC9 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Trim58Q5NCC9 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
Trim58Q5NCC9 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Trim58Q5NCC9 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Trim58Q5NCC9 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Trim58Q5NCC9 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Trim58Q5NCC9 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Trim58Q5NCC9 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Trim58Q5NCC9 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Trim58Q5NCC9 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Trim58Q5NCC9 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Trim58Q5NCC9 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Trim58Q5NCC9 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Trim58Q5NCC9 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
Trim58Q5NCC9 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Trim58Q5NCC9 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Trim58Q5NCC9 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Trim58Q5NCC9 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Trim58Q5NCC9 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Trim58Q5NCC9 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Trim58Q5NCC9 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Trim58Q5NCC9 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Trim58Q5NCC9 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Trim58Q5NCC9 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.5 ms