Protein–RNA interactions for Protein: Q5HZG4

Taf3, Transcription initiation factor TFIID subunit 3, mousemouse

Predictions only

Length 932 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Taf3Q5HZG4 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Taf3Q5HZG4 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Taf3Q5HZG4 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Taf3Q5HZG4 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Taf3Q5HZG4 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Taf3Q5HZG4 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Taf3Q5HZG4 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Taf3Q5HZG4 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Taf3Q5HZG4 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Taf3Q5HZG4 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Taf3Q5HZG4 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Taf3Q5HZG4 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Taf3Q5HZG4 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Taf3Q5HZG4 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Taf3Q5HZG4 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Taf3Q5HZG4 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Taf3Q5HZG4 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Taf3Q5HZG4 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Taf3Q5HZG4 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Taf3Q5HZG4 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Taf3Q5HZG4 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Taf3Q5HZG4 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Taf3Q5HZG4 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Taf3Q5HZG4 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Taf3Q5HZG4 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Taf3Q5HZG4 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Taf3Q5HZG4 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Taf3Q5HZG4 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Taf3Q5HZG4 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Taf3Q5HZG4 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Taf3Q5HZG4 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Taf3Q5HZG4 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Taf3Q5HZG4 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Taf3Q5HZG4 Ncs1-201ENSMUST00000000199 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Taf3Q5HZG4 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Taf3Q5HZG4 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Taf3Q5HZG4 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Taf3Q5HZG4 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Taf3Q5HZG4 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Taf3Q5HZG4 Sirpa-202ENSMUST00000099113 3342 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Taf3Q5HZG4 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Taf3Q5HZG4 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Taf3Q5HZG4 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Taf3Q5HZG4 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Taf3Q5HZG4 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Taf3Q5HZG4 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Taf3Q5HZG4 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Taf3Q5HZG4 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Taf3Q5HZG4 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Taf3Q5HZG4 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Taf3Q5HZG4 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Taf3Q5HZG4 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Taf3Q5HZG4 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Taf3Q5HZG4 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Taf3Q5HZG4 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Taf3Q5HZG4 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Taf3Q5HZG4 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Taf3Q5HZG4 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Taf3Q5HZG4 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Taf3Q5HZG4 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Taf3Q5HZG4 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Taf3Q5HZG4 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Taf3Q5HZG4 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Taf3Q5HZG4 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Taf3Q5HZG4 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Taf3Q5HZG4 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Taf3Q5HZG4 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Taf3Q5HZG4 Pcsk5-201ENSMUST00000025618 6675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Taf3Q5HZG4 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Taf3Q5HZG4 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Taf3Q5HZG4 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Taf3Q5HZG4 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Taf3Q5HZG4 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Taf3Q5HZG4 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Taf3Q5HZG4 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Taf3Q5HZG4 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Taf3Q5HZG4 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Taf3Q5HZG4 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Taf3Q5HZG4 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Taf3Q5HZG4 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Taf3Q5HZG4 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Taf3Q5HZG4 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Taf3Q5HZG4 Etl4-208ENSMUST00000114614 5898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Taf3Q5HZG4 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Taf3Q5HZG4 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Taf3Q5HZG4 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Taf3Q5HZG4 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Taf3Q5HZG4 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Taf3Q5HZG4 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Taf3Q5HZG4 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Taf3Q5HZG4 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Taf3Q5HZG4 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Taf3Q5HZG4 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Taf3Q5HZG4 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Taf3Q5HZG4 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Taf3Q5HZG4 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Taf3Q5HZG4 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Taf3Q5HZG4 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Taf3Q5HZG4 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Taf3Q5HZG4 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.8 ms