Protein–RNA interactions for Protein: Q5EG47

Prkaa1, 5'-AMP-activated protein kinase catalytic subunit alpha-1, mousemouse

Predictions only

Length 559 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prkaa1Q5EG47 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Prkaa1Q5EG47 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Prkaa1Q5EG47 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Prkaa1Q5EG47 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Prkaa1Q5EG47 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Prkaa1Q5EG47 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Prkaa1Q5EG47 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Prkaa1Q5EG47 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Prkaa1Q5EG47 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Prkaa1Q5EG47 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Prkaa1Q5EG47 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Prkaa1Q5EG47 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Prkaa1Q5EG47 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Prkaa1Q5EG47 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Prkaa1Q5EG47 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Prkaa1Q5EG47 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Prkaa1Q5EG47 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Prkaa1Q5EG47 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Prkaa1Q5EG47 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Prkaa1Q5EG47 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Prkaa1Q5EG47 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Prkaa1Q5EG47 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Prkaa1Q5EG47 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Prkaa1Q5EG47 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Prkaa1Q5EG47 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Prkaa1Q5EG47 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Prkaa1Q5EG47 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Prkaa1Q5EG47 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Prkaa1Q5EG47 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Prkaa1Q5EG47 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Prkaa1Q5EG47 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Prkaa1Q5EG47 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Prkaa1Q5EG47 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Prkaa1Q5EG47 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Prkaa1Q5EG47 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Prkaa1Q5EG47 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Prkaa1Q5EG47 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Prkaa1Q5EG47 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Prkaa1Q5EG47 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Prkaa1Q5EG47 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Prkaa1Q5EG47 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Prkaa1Q5EG47 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Prkaa1Q5EG47 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Prkaa1Q5EG47 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Prkaa1Q5EG47 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Prkaa1Q5EG47 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Prkaa1Q5EG47 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Prkaa1Q5EG47 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Prkaa1Q5EG47 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Prkaa1Q5EG47 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.18
Prkaa1Q5EG47 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Prkaa1Q5EG47 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Prkaa1Q5EG47 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Prkaa1Q5EG47 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Prkaa1Q5EG47 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Prkaa1Q5EG47 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Prkaa1Q5EG47 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Prkaa1Q5EG47 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Prkaa1Q5EG47 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Prkaa1Q5EG47 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Prkaa1Q5EG47 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Prkaa1Q5EG47 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Prkaa1Q5EG47 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Prkaa1Q5EG47 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Prkaa1Q5EG47 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Prkaa1Q5EG47 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Prkaa1Q5EG47 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Prkaa1Q5EG47 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Prkaa1Q5EG47 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Prkaa1Q5EG47 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Prkaa1Q5EG47 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Prkaa1Q5EG47 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Prkaa1Q5EG47 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Prkaa1Q5EG47 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Prkaa1Q5EG47 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Prkaa1Q5EG47 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Prkaa1Q5EG47 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Prkaa1Q5EG47 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Prkaa1Q5EG47 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Prkaa1Q5EG47 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Prkaa1Q5EG47 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Prkaa1Q5EG47 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Prkaa1Q5EG47 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Prkaa1Q5EG47 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Prkaa1Q5EG47 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Prkaa1Q5EG47 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Prkaa1Q5EG47 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Prkaa1Q5EG47 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Prkaa1Q5EG47 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Prkaa1Q5EG47 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Prkaa1Q5EG47 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Prkaa1Q5EG47 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Prkaa1Q5EG47 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Prkaa1Q5EG47 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Prkaa1Q5EG47 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Prkaa1Q5EG47 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Prkaa1Q5EG47 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Prkaa1Q5EG47 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Prkaa1Q5EG47 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Prkaa1Q5EG47 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.1 ms