Protein–RNA interactions for Protein: Q59J78

Ndufaf2, NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex assembly factor 2, mousemouse

Predictions only

Length 168 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ndufaf2Q59J78 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ndufaf2Q59J78 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ndufaf2Q59J78 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ndufaf2Q59J78 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ndufaf2Q59J78 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ndufaf2Q59J78 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ndufaf2Q59J78 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ndufaf2Q59J78 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ndufaf2Q59J78 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ndufaf2Q59J78 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ndufaf2Q59J78 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ndufaf2Q59J78 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ndufaf2Q59J78 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ndufaf2Q59J78 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ndufaf2Q59J78 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ndufaf2Q59J78 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ndufaf2Q59J78 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ndufaf2Q59J78 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ndufaf2Q59J78 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ndufaf2Q59J78 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ndufaf2Q59J78 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ndufaf2Q59J78 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ndufaf2Q59J78 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ndufaf2Q59J78 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ndufaf2Q59J78 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Ndufaf2Q59J78 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ndufaf2Q59J78 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ndufaf2Q59J78 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ndufaf2Q59J78 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ndufaf2Q59J78 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ndufaf2Q59J78 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ndufaf2Q59J78 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ndufaf2Q59J78 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ndufaf2Q59J78 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ndufaf2Q59J78 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ndufaf2Q59J78 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Ndufaf2Q59J78 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ndufaf2Q59J78 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ndufaf2Q59J78 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ndufaf2Q59J78 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ndufaf2Q59J78 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ndufaf2Q59J78 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Ndufaf2Q59J78 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ndufaf2Q59J78 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ndufaf2Q59J78 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ndufaf2Q59J78 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ndufaf2Q59J78 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ndufaf2Q59J78 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ndufaf2Q59J78 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ndufaf2Q59J78 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ndufaf2Q59J78 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ndufaf2Q59J78 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ndufaf2Q59J78 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ndufaf2Q59J78 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ndufaf2Q59J78 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ndufaf2Q59J78 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ndufaf2Q59J78 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Ndufaf2Q59J78 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ndufaf2Q59J78 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ndufaf2Q59J78 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ndufaf2Q59J78 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ndufaf2Q59J78 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ndufaf2Q59J78 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ndufaf2Q59J78 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Ndufaf2Q59J78 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC16.39■□□□□ 0.22
Ndufaf2Q59J78 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Ndufaf2Q59J78 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ndufaf2Q59J78 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ndufaf2Q59J78 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ndufaf2Q59J78 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ndufaf2Q59J78 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ndufaf2Q59J78 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ndufaf2Q59J78 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ndufaf2Q59J78 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ndufaf2Q59J78 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Ndufaf2Q59J78 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ndufaf2Q59J78 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ndufaf2Q59J78 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ndufaf2Q59J78 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ndufaf2Q59J78 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ndufaf2Q59J78 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ndufaf2Q59J78 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ndufaf2Q59J78 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ndufaf2Q59J78 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ndufaf2Q59J78 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ndufaf2Q59J78 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ndufaf2Q59J78 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ndufaf2Q59J78 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ndufaf2Q59J78 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ndufaf2Q59J78 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ndufaf2Q59J78 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ndufaf2Q59J78 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ndufaf2Q59J78 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ndufaf2Q59J78 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ndufaf2Q59J78 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ndufaf2Q59J78 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ndufaf2Q59J78 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ndufaf2Q59J78 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ndufaf2Q59J78 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ndufaf2Q59J78 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.4 ms