Protein–RNA interactions for Protein: Q58FA4

E2f8, Transcription factor E2F8, mousemouse

Predictions only

Length 860 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2f8Q58FA4 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
E2f8Q58FA4 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
E2f8Q58FA4 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
E2f8Q58FA4 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
E2f8Q58FA4 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
E2f8Q58FA4 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
E2f8Q58FA4 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
E2f8Q58FA4 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
E2f8Q58FA4 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
E2f8Q58FA4 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
E2f8Q58FA4 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
E2f8Q58FA4 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
E2f8Q58FA4 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
E2f8Q58FA4 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
E2f8Q58FA4 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
E2f8Q58FA4 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
E2f8Q58FA4 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
E2f8Q58FA4 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
E2f8Q58FA4 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
E2f8Q58FA4 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
E2f8Q58FA4 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
E2f8Q58FA4 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
E2f8Q58FA4 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
E2f8Q58FA4 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
E2f8Q58FA4 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
E2f8Q58FA4 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
E2f8Q58FA4 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
E2f8Q58FA4 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
E2f8Q58FA4 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
E2f8Q58FA4 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
E2f8Q58FA4 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
E2f8Q58FA4 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
E2f8Q58FA4 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
E2f8Q58FA4 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
E2f8Q58FA4 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
E2f8Q58FA4 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
E2f8Q58FA4 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
E2f8Q58FA4 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
E2f8Q58FA4 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
E2f8Q58FA4 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
E2f8Q58FA4 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
E2f8Q58FA4 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
E2f8Q58FA4 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
E2f8Q58FA4 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
E2f8Q58FA4 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
E2f8Q58FA4 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
E2f8Q58FA4 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
E2f8Q58FA4 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
E2f8Q58FA4 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
E2f8Q58FA4 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
E2f8Q58FA4 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
E2f8Q58FA4 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
E2f8Q58FA4 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
E2f8Q58FA4 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
E2f8Q58FA4 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
E2f8Q58FA4 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
E2f8Q58FA4 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
E2f8Q58FA4 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
E2f8Q58FA4 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
E2f8Q58FA4 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
E2f8Q58FA4 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
E2f8Q58FA4 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
E2f8Q58FA4 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
E2f8Q58FA4 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
E2f8Q58FA4 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
E2f8Q58FA4 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
E2f8Q58FA4 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
E2f8Q58FA4 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
E2f8Q58FA4 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
E2f8Q58FA4 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
E2f8Q58FA4 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
E2f8Q58FA4 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
E2f8Q58FA4 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
E2f8Q58FA4 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
E2f8Q58FA4 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
E2f8Q58FA4 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
E2f8Q58FA4 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
E2f8Q58FA4 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
E2f8Q58FA4 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
E2f8Q58FA4 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
E2f8Q58FA4 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
E2f8Q58FA4 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
E2f8Q58FA4 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
E2f8Q58FA4 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
E2f8Q58FA4 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
E2f8Q58FA4 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
E2f8Q58FA4 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
E2f8Q58FA4 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
E2f8Q58FA4 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
E2f8Q58FA4 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
E2f8Q58FA4 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
E2f8Q58FA4 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
E2f8Q58FA4 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
E2f8Q58FA4 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
E2f8Q58FA4 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
E2f8Q58FA4 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
E2f8Q58FA4 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
E2f8Q58FA4 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
E2f8Q58FA4 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
E2f8Q58FA4 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.8 ms