Protein–RNA interactions for Protein: Q3V036

Ccdc27, Coiled-coil domain-containing protein 27, mousemouse

Predictions only

Length 639 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc27Q3V036 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Ccdc27Q3V036 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ccdc27Q3V036 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ccdc27Q3V036 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ccdc27Q3V036 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ccdc27Q3V036 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Ccdc27Q3V036 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ccdc27Q3V036 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ccdc27Q3V036 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ccdc27Q3V036 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ccdc27Q3V036 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ccdc27Q3V036 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ccdc27Q3V036 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ccdc27Q3V036 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ccdc27Q3V036 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ccdc27Q3V036 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ccdc27Q3V036 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ccdc27Q3V036 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ccdc27Q3V036 Slc52a3-203ENSMUST00000109859 2204 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ccdc27Q3V036 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ccdc27Q3V036 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ccdc27Q3V036 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ccdc27Q3V036 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ccdc27Q3V036 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ccdc27Q3V036 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ccdc27Q3V036 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ccdc27Q3V036 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ccdc27Q3V036 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ccdc27Q3V036 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ccdc27Q3V036 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ccdc27Q3V036 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ccdc27Q3V036 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Ccdc27Q3V036 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ccdc27Q3V036 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ccdc27Q3V036 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Ccdc27Q3V036 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ccdc27Q3V036 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ccdc27Q3V036 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ccdc27Q3V036 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ccdc27Q3V036 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ccdc27Q3V036 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ccdc27Q3V036 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ccdc27Q3V036 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ccdc27Q3V036 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ccdc27Q3V036 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ccdc27Q3V036 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ccdc27Q3V036 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ccdc27Q3V036 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ccdc27Q3V036 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ccdc27Q3V036 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ccdc27Q3V036 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ccdc27Q3V036 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ccdc27Q3V036 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ccdc27Q3V036 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ccdc27Q3V036 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ccdc27Q3V036 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ccdc27Q3V036 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ccdc27Q3V036 Gm996-203ENSMUST00000188161 2925 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ccdc27Q3V036 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ccdc27Q3V036 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ccdc27Q3V036 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ccdc27Q3V036 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ccdc27Q3V036 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Ccdc27Q3V036 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ccdc27Q3V036 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ccdc27Q3V036 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ccdc27Q3V036 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ccdc27Q3V036 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ccdc27Q3V036 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ccdc27Q3V036 Zbp1-201ENSMUST00000029018 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ccdc27Q3V036 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ccdc27Q3V036 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ccdc27Q3V036 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ccdc27Q3V036 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ccdc27Q3V036 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ccdc27Q3V036 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ccdc27Q3V036 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ccdc27Q3V036 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ccdc27Q3V036 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ccdc27Q3V036 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ccdc27Q3V036 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ccdc27Q3V036 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ccdc27Q3V036 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ccdc27Q3V036 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ccdc27Q3V036 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ccdc27Q3V036 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ccdc27Q3V036 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ccdc27Q3V036 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ccdc27Q3V036 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ccdc27Q3V036 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ccdc27Q3V036 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ccdc27Q3V036 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ccdc27Q3V036 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccdc27Q3V036 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccdc27Q3V036 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccdc27Q3V036 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccdc27Q3V036 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccdc27Q3V036 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccdc27Q3V036 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccdc27Q3V036 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.2 ms