Protein–RNA interactions for Protein: Q3V016

Hipk4, Homeodomain-interacting protein kinase 4, mousemouse

Predictions only

Length 616 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hipk4Q3V016 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Hipk4Q3V016 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Hipk4Q3V016 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Hipk4Q3V016 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Hipk4Q3V016 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Hipk4Q3V016 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Hipk4Q3V016 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Hipk4Q3V016 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Hipk4Q3V016 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Hipk4Q3V016 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Hipk4Q3V016 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Hipk4Q3V016 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Hipk4Q3V016 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Hipk4Q3V016 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Hipk4Q3V016 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Hipk4Q3V016 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Hipk4Q3V016 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Hipk4Q3V016 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Hipk4Q3V016 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Hipk4Q3V016 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Hipk4Q3V016 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Hipk4Q3V016 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Hipk4Q3V016 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Hipk4Q3V016 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Hipk4Q3V016 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Hipk4Q3V016 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Hipk4Q3V016 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Hipk4Q3V016 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Hipk4Q3V016 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Hipk4Q3V016 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Hipk4Q3V016 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Hipk4Q3V016 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Hipk4Q3V016 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Hipk4Q3V016 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Hipk4Q3V016 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Hipk4Q3V016 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Hipk4Q3V016 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Hipk4Q3V016 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Hipk4Q3V016 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Hipk4Q3V016 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Hipk4Q3V016 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Hipk4Q3V016 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
Hipk4Q3V016 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Hipk4Q3V016 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Hipk4Q3V016 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Hipk4Q3V016 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hipk4Q3V016 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hipk4Q3V016 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hipk4Q3V016 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hipk4Q3V016 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hipk4Q3V016 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hipk4Q3V016 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hipk4Q3V016 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hipk4Q3V016 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hipk4Q3V016 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hipk4Q3V016 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hipk4Q3V016 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hipk4Q3V016 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Hipk4Q3V016 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hipk4Q3V016 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hipk4Q3V016 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hipk4Q3V016 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hipk4Q3V016 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hipk4Q3V016 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hipk4Q3V016 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hipk4Q3V016 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hipk4Q3V016 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hipk4Q3V016 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hipk4Q3V016 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hipk4Q3V016 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hipk4Q3V016 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hipk4Q3V016 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hipk4Q3V016 Dock4-201ENSMUST00000037488 8552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hipk4Q3V016 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hipk4Q3V016 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hipk4Q3V016 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hipk4Q3V016 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Hipk4Q3V016 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hipk4Q3V016 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hipk4Q3V016 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hipk4Q3V016 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hipk4Q3V016 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hipk4Q3V016 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hipk4Q3V016 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Hipk4Q3V016 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hipk4Q3V016 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hipk4Q3V016 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hipk4Q3V016 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hipk4Q3V016 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hipk4Q3V016 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hipk4Q3V016 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hipk4Q3V016 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hipk4Q3V016 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hipk4Q3V016 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hipk4Q3V016 Magi1-208ENSMUST00000204347 7929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hipk4Q3V016 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hipk4Q3V016 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hipk4Q3V016 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hipk4Q3V016 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hipk4Q3V016 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.9 ms