Protein–RNA interactions for Protein: Q3UW68

Capn13, Calpain-13, mousemouse

Predictions only

Length 665 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Capn13Q3UW68 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Capn13Q3UW68 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Capn13Q3UW68 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Capn13Q3UW68 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Capn13Q3UW68 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Capn13Q3UW68 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Capn13Q3UW68 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Capn13Q3UW68 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Capn13Q3UW68 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Capn13Q3UW68 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Capn13Q3UW68 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Capn13Q3UW68 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Capn13Q3UW68 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Capn13Q3UW68 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Capn13Q3UW68 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Capn13Q3UW68 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Capn13Q3UW68 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Capn13Q3UW68 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Capn13Q3UW68 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Capn13Q3UW68 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Capn13Q3UW68 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Capn13Q3UW68 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Capn13Q3UW68 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Capn13Q3UW68 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Capn13Q3UW68 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Capn13Q3UW68 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Capn13Q3UW68 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Capn13Q3UW68 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Capn13Q3UW68 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Capn13Q3UW68 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Capn13Q3UW68 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Capn13Q3UW68 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Capn13Q3UW68 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Capn13Q3UW68 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Capn13Q3UW68 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Capn13Q3UW68 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Capn13Q3UW68 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Capn13Q3UW68 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Capn13Q3UW68 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Capn13Q3UW68 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Capn13Q3UW68 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Capn13Q3UW68 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Capn13Q3UW68 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Capn13Q3UW68 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Capn13Q3UW68 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Capn13Q3UW68 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Capn13Q3UW68 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Capn13Q3UW68 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Capn13Q3UW68 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Capn13Q3UW68 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Capn13Q3UW68 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Capn13Q3UW68 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Capn13Q3UW68 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Capn13Q3UW68 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Capn13Q3UW68 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Capn13Q3UW68 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Capn13Q3UW68 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Capn13Q3UW68 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Capn13Q3UW68 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Capn13Q3UW68 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Capn13Q3UW68 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Capn13Q3UW68 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Capn13Q3UW68 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Capn13Q3UW68 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Capn13Q3UW68 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Capn13Q3UW68 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Capn13Q3UW68 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Capn13Q3UW68 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Capn13Q3UW68 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Capn13Q3UW68 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Capn13Q3UW68 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Capn13Q3UW68 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Capn13Q3UW68 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Capn13Q3UW68 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Capn13Q3UW68 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Capn13Q3UW68 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Capn13Q3UW68 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Capn13Q3UW68 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Capn13Q3UW68 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Capn13Q3UW68 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Capn13Q3UW68 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Capn13Q3UW68 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Capn13Q3UW68 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Capn13Q3UW68 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Capn13Q3UW68 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Capn13Q3UW68 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Capn13Q3UW68 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Capn13Q3UW68 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Capn13Q3UW68 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Capn13Q3UW68 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Capn13Q3UW68 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Capn13Q3UW68 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Capn13Q3UW68 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Capn13Q3UW68 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Capn13Q3UW68 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Capn13Q3UW68 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Capn13Q3UW68 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Capn13Q3UW68 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Capn13Q3UW68 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Capn13Q3UW68 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.8 ms