Protein–RNA interactions for Protein: Q3UW22

Defb48, Beta-defensin 42, mousemouse

Predictions only

Length 87 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defb48Q3UW22 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Defb48Q3UW22 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Defb48Q3UW22 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Defb48Q3UW22 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Defb48Q3UW22 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Defb48Q3UW22 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Defb48Q3UW22 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Defb48Q3UW22 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Defb48Q3UW22 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Defb48Q3UW22 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Defb48Q3UW22 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Defb48Q3UW22 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Defb48Q3UW22 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Defb48Q3UW22 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Defb48Q3UW22 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Defb48Q3UW22 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Defb48Q3UW22 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Defb48Q3UW22 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Defb48Q3UW22 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Defb48Q3UW22 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Defb48Q3UW22 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Defb48Q3UW22 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Defb48Q3UW22 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Defb48Q3UW22 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Defb48Q3UW22 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Defb48Q3UW22 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Defb48Q3UW22 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Defb48Q3UW22 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Defb48Q3UW22 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Defb48Q3UW22 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Defb48Q3UW22 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Defb48Q3UW22 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Defb48Q3UW22 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Defb48Q3UW22 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Defb48Q3UW22 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Defb48Q3UW22 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Defb48Q3UW22 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Defb48Q3UW22 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Defb48Q3UW22 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Defb48Q3UW22 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Defb48Q3UW22 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Defb48Q3UW22 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Defb48Q3UW22 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Defb48Q3UW22 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Defb48Q3UW22 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Defb48Q3UW22 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Defb48Q3UW22 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Defb48Q3UW22 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Defb48Q3UW22 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Defb48Q3UW22 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Defb48Q3UW22 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Defb48Q3UW22 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Defb48Q3UW22 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Defb48Q3UW22 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Defb48Q3UW22 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Defb48Q3UW22 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Defb48Q3UW22 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Defb48Q3UW22 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Defb48Q3UW22 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Defb48Q3UW22 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Defb48Q3UW22 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Defb48Q3UW22 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Defb48Q3UW22 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Defb48Q3UW22 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Defb48Q3UW22 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Defb48Q3UW22 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Defb48Q3UW22 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Defb48Q3UW22 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Defb48Q3UW22 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Defb48Q3UW22 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Defb48Q3UW22 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Defb48Q3UW22 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Defb48Q3UW22 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Defb48Q3UW22 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Defb48Q3UW22 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Defb48Q3UW22 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Defb48Q3UW22 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Defb48Q3UW22 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Defb48Q3UW22 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Defb48Q3UW22 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Defb48Q3UW22 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Defb48Q3UW22 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Defb48Q3UW22 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Defb48Q3UW22 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Defb48Q3UW22 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Defb48Q3UW22 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Defb48Q3UW22 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Defb48Q3UW22 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Defb48Q3UW22 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Defb48Q3UW22 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Defb48Q3UW22 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Defb48Q3UW22 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Defb48Q3UW22 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Defb48Q3UW22 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Defb48Q3UW22 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Defb48Q3UW22 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Defb48Q3UW22 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Defb48Q3UW22 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Defb48Q3UW22 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Defb48Q3UW22 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.4 ms