Protein–RNA interactions for Protein: Q3USJ8

Fchsd2, F-BAR and double SH3 domains protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 740 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fchsd2Q3USJ8 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Fchsd2Q3USJ8 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
Fchsd2Q3USJ8 Psmb5-ps-201ENSMUST00000119744 798 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
Fchsd2Q3USJ8 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Fchsd2Q3USJ8 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
Fchsd2Q3USJ8 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Fchsd2Q3USJ8 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Fchsd2Q3USJ8 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Fchsd2Q3USJ8 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Fchsd2Q3USJ8 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Fchsd2Q3USJ8 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Fchsd2Q3USJ8 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Fchsd2Q3USJ8 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Fchsd2Q3USJ8 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Fchsd2Q3USJ8 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
Fchsd2Q3USJ8 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Fchsd2Q3USJ8 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Fchsd2Q3USJ8 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Fchsd2Q3USJ8 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Fchsd2Q3USJ8 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Fchsd2Q3USJ8 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Fchsd2Q3USJ8 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Fchsd2Q3USJ8 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Fchsd2Q3USJ8 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Fchsd2Q3USJ8 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Fchsd2Q3USJ8 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
Fchsd2Q3USJ8 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Fchsd2Q3USJ8 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Fchsd2Q3USJ8 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Fchsd2Q3USJ8 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Fchsd2Q3USJ8 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Fchsd2Q3USJ8 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Fchsd2Q3USJ8 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Fchsd2Q3USJ8 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Fchsd2Q3USJ8 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Fchsd2Q3USJ8 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Fchsd2Q3USJ8 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Fchsd2Q3USJ8 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
Fchsd2Q3USJ8 Nup188-205ENSMUST00000138666 534 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Fchsd2Q3USJ8 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Fchsd2Q3USJ8 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Fchsd2Q3USJ8 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Fchsd2Q3USJ8 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Fchsd2Q3USJ8 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Fchsd2Q3USJ8 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Fchsd2Q3USJ8 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Fchsd2Q3USJ8 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Fchsd2Q3USJ8 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Fchsd2Q3USJ8 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Fchsd2Q3USJ8 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Fchsd2Q3USJ8 Acp5-201ENSMUST00000069330 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Fchsd2Q3USJ8 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Fchsd2Q3USJ8 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Fchsd2Q3USJ8 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Fchsd2Q3USJ8 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
Fchsd2Q3USJ8 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Fchsd2Q3USJ8 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Fchsd2Q3USJ8 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
Fchsd2Q3USJ8 Wdyhv1-206ENSMUST00000227142 786 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
Fchsd2Q3USJ8 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Fchsd2Q3USJ8 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Fchsd2Q3USJ8 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Fchsd2Q3USJ8 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Fchsd2Q3USJ8 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Fchsd2Q3USJ8 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Fchsd2Q3USJ8 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Fchsd2Q3USJ8 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Fchsd2Q3USJ8 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Fchsd2Q3USJ8 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Fchsd2Q3USJ8 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Fchsd2Q3USJ8 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Fchsd2Q3USJ8 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Fchsd2Q3USJ8 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Fchsd2Q3USJ8 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Fchsd2Q3USJ8 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Fchsd2Q3USJ8 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Fchsd2Q3USJ8 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Fchsd2Q3USJ8 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Fchsd2Q3USJ8 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Fchsd2Q3USJ8 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Fchsd2Q3USJ8 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Fchsd2Q3USJ8 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Fchsd2Q3USJ8 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Fchsd2Q3USJ8 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Fchsd2Q3USJ8 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Fchsd2Q3USJ8 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Fchsd2Q3USJ8 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Fchsd2Q3USJ8 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Fchsd2Q3USJ8 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Fchsd2Q3USJ8 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Fchsd2Q3USJ8 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Fchsd2Q3USJ8 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Fchsd2Q3USJ8 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Fchsd2Q3USJ8 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
Fchsd2Q3USJ8 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Fchsd2Q3USJ8 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Fchsd2Q3USJ8 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Fchsd2Q3USJ8 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Fchsd2Q3USJ8 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Fchsd2Q3USJ8 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.2 ms