Protein–RNA interactions for Protein: Q3UPR8

D13Ertd608e, D13Ertd608e protein, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
D13Ertd608eQ3UPR8 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
D13Ertd608eQ3UPR8 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC14.53□□□□□ -0.08
D13Ertd608eQ3UPR8 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
D13Ertd608eQ3UPR8 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
D13Ertd608eQ3UPR8 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
D13Ertd608eQ3UPR8 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
D13Ertd608eQ3UPR8 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
D13Ertd608eQ3UPR8 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
D13Ertd608eQ3UPR8 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
D13Ertd608eQ3UPR8 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.08
D13Ertd608eQ3UPR8 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
D13Ertd608eQ3UPR8 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC14.52□□□□□ -0.08
D13Ertd608eQ3UPR8 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC14.52□□□□□ -0.08
D13Ertd608eQ3UPR8 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
D13Ertd608eQ3UPR8 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
D13Ertd608eQ3UPR8 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
D13Ertd608eQ3UPR8 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
D13Ertd608eQ3UPR8 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
D13Ertd608eQ3UPR8 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
D13Ertd608eQ3UPR8 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
D13Ertd608eQ3UPR8 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
D13Ertd608eQ3UPR8 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
D13Ertd608eQ3UPR8 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
D13Ertd608eQ3UPR8 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
D13Ertd608eQ3UPR8 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
D13Ertd608eQ3UPR8 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
D13Ertd608eQ3UPR8 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
D13Ertd608eQ3UPR8 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
D13Ertd608eQ3UPR8 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
D13Ertd608eQ3UPR8 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
D13Ertd608eQ3UPR8 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
D13Ertd608eQ3UPR8 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
D13Ertd608eQ3UPR8 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
D13Ertd608eQ3UPR8 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
D13Ertd608eQ3UPR8 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
D13Ertd608eQ3UPR8 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
D13Ertd608eQ3UPR8 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
D13Ertd608eQ3UPR8 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
D13Ertd608eQ3UPR8 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
D13Ertd608eQ3UPR8 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
D13Ertd608eQ3UPR8 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
D13Ertd608eQ3UPR8 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
D13Ertd608eQ3UPR8 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
D13Ertd608eQ3UPR8 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
D13Ertd608eQ3UPR8 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
D13Ertd608eQ3UPR8 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
D13Ertd608eQ3UPR8 Trank1-201ENSMUST00000078626 10520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
D13Ertd608eQ3UPR8 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
D13Ertd608eQ3UPR8 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
D13Ertd608eQ3UPR8 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
D13Ertd608eQ3UPR8 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
D13Ertd608eQ3UPR8 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
D13Ertd608eQ3UPR8 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
D13Ertd608eQ3UPR8 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
D13Ertd608eQ3UPR8 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
D13Ertd608eQ3UPR8 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
D13Ertd608eQ3UPR8 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
D13Ertd608eQ3UPR8 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
D13Ertd608eQ3UPR8 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
D13Ertd608eQ3UPR8 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
D13Ertd608eQ3UPR8 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
D13Ertd608eQ3UPR8 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
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D13Ertd608eQ3UPR8 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
D13Ertd608eQ3UPR8 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
D13Ertd608eQ3UPR8 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
D13Ertd608eQ3UPR8 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
D13Ertd608eQ3UPR8 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
D13Ertd608eQ3UPR8 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
D13Ertd608eQ3UPR8 Plod2-203ENSMUST00000160359 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
D13Ertd608eQ3UPR8 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
D13Ertd608eQ3UPR8 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
D13Ertd608eQ3UPR8 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
D13Ertd608eQ3UPR8 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
D13Ertd608eQ3UPR8 Arid4b-201ENSMUST00000039538 5844 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
D13Ertd608eQ3UPR8 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
D13Ertd608eQ3UPR8 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
D13Ertd608eQ3UPR8 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
D13Ertd608eQ3UPR8 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
D13Ertd608eQ3UPR8 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
D13Ertd608eQ3UPR8 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
D13Ertd608eQ3UPR8 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
D13Ertd608eQ3UPR8 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
D13Ertd608eQ3UPR8 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
D13Ertd608eQ3UPR8 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
D13Ertd608eQ3UPR8 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
D13Ertd608eQ3UPR8 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
D13Ertd608eQ3UPR8 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
D13Ertd608eQ3UPR8 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
D13Ertd608eQ3UPR8 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
D13Ertd608eQ3UPR8 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
D13Ertd608eQ3UPR8 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
D13Ertd608eQ3UPR8 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
D13Ertd608eQ3UPR8 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
D13Ertd608eQ3UPR8 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
D13Ertd608eQ3UPR8 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
D13Ertd608eQ3UPR8 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
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