Protein–RNA interactions for Protein: Q3UPL0

Sec31a, Protein transport protein Sec31A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,230 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sec31aQ3UPL0 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Sec31aQ3UPL0 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Sec31aQ3UPL0 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sec31aQ3UPL0 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sec31aQ3UPL0 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sec31aQ3UPL0 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sec31aQ3UPL0 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sec31aQ3UPL0 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sec31aQ3UPL0 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sec31aQ3UPL0 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sec31aQ3UPL0 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sec31aQ3UPL0 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sec31aQ3UPL0 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sec31aQ3UPL0 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sec31aQ3UPL0 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sec31aQ3UPL0 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sec31aQ3UPL0 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sec31aQ3UPL0 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sec31aQ3UPL0 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sec31aQ3UPL0 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sec31aQ3UPL0 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sec31aQ3UPL0 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sec31aQ3UPL0 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sec31aQ3UPL0 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sec31aQ3UPL0 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sec31aQ3UPL0 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sec31aQ3UPL0 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sec31aQ3UPL0 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sec31aQ3UPL0 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sec31aQ3UPL0 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sec31aQ3UPL0 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sec31aQ3UPL0 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sec31aQ3UPL0 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sec31aQ3UPL0 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sec31aQ3UPL0 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sec31aQ3UPL0 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sec31aQ3UPL0 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sec31aQ3UPL0 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sec31aQ3UPL0 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sec31aQ3UPL0 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sec31aQ3UPL0 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sec31aQ3UPL0 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sec31aQ3UPL0 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sec31aQ3UPL0 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sec31aQ3UPL0 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sec31aQ3UPL0 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sec31aQ3UPL0 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sec31aQ3UPL0 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sec31aQ3UPL0 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sec31aQ3UPL0 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sec31aQ3UPL0 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sec31aQ3UPL0 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sec31aQ3UPL0 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sec31aQ3UPL0 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sec31aQ3UPL0 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sec31aQ3UPL0 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sec31aQ3UPL0 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sec31aQ3UPL0 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sec31aQ3UPL0 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sec31aQ3UPL0 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sec31aQ3UPL0 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sec31aQ3UPL0 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Sec31aQ3UPL0 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Sec31aQ3UPL0 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Sec31aQ3UPL0 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Sec31aQ3UPL0 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Sec31aQ3UPL0 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Sec31aQ3UPL0 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Sec31aQ3UPL0 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Sec31aQ3UPL0 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Sec31aQ3UPL0 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Sec31aQ3UPL0 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Sec31aQ3UPL0 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Sec31aQ3UPL0 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Sec31aQ3UPL0 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Sec31aQ3UPL0 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Sec31aQ3UPL0 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Sec31aQ3UPL0 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Sec31aQ3UPL0 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Sec31aQ3UPL0 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Sec31aQ3UPL0 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Sec31aQ3UPL0 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Sec31aQ3UPL0 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Sec31aQ3UPL0 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Sec31aQ3UPL0 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Sec31aQ3UPL0 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Sec31aQ3UPL0 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Sec31aQ3UPL0 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Sec31aQ3UPL0 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Sec31aQ3UPL0 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Sec31aQ3UPL0 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Sec31aQ3UPL0 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Sec31aQ3UPL0 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Sec31aQ3UPL0 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Sec31aQ3UPL0 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Sec31aQ3UPL0 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Sec31aQ3UPL0 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Sec31aQ3UPL0 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Sec31aQ3UPL0 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Sec31aQ3UPL0 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.4 ms