Protein–RNA interactions for Protein: Q3UJD6

Usp19, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 19, mousemouse

Predictions only

Length 1,360 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp19Q3UJD6 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Usp19Q3UJD6 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Usp19Q3UJD6 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Usp19Q3UJD6 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Usp19Q3UJD6 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Usp19Q3UJD6 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Usp19Q3UJD6 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Usp19Q3UJD6 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Usp19Q3UJD6 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Usp19Q3UJD6 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Usp19Q3UJD6 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Usp19Q3UJD6 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Usp19Q3UJD6 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Usp19Q3UJD6 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Usp19Q3UJD6 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Usp19Q3UJD6 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Usp19Q3UJD6 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Usp19Q3UJD6 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Usp19Q3UJD6 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Usp19Q3UJD6 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Usp19Q3UJD6 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Usp19Q3UJD6 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Usp19Q3UJD6 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Usp19Q3UJD6 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Usp19Q3UJD6 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Usp19Q3UJD6 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Usp19Q3UJD6 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Usp19Q3UJD6 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Usp19Q3UJD6 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Usp19Q3UJD6 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Usp19Q3UJD6 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Usp19Q3UJD6 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Usp19Q3UJD6 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Usp19Q3UJD6 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Usp19Q3UJD6 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Usp19Q3UJD6 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Usp19Q3UJD6 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Usp19Q3UJD6 Gm5186-201ENSMUST00000218781 920 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Usp19Q3UJD6 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Usp19Q3UJD6 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Usp19Q3UJD6 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Usp19Q3UJD6 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Usp19Q3UJD6 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Usp19Q3UJD6 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Usp19Q3UJD6 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Usp19Q3UJD6 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Usp19Q3UJD6 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Usp19Q3UJD6 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Usp19Q3UJD6 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Usp19Q3UJD6 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Usp19Q3UJD6 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Usp19Q3UJD6 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Usp19Q3UJD6 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Usp19Q3UJD6 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Usp19Q3UJD6 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Usp19Q3UJD6 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Usp19Q3UJD6 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Usp19Q3UJD6 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Usp19Q3UJD6 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Usp19Q3UJD6 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Usp19Q3UJD6 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Usp19Q3UJD6 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Usp19Q3UJD6 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Usp19Q3UJD6 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Usp19Q3UJD6 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Usp19Q3UJD6 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Usp19Q3UJD6 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Usp19Q3UJD6 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Usp19Q3UJD6 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Usp19Q3UJD6 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Usp19Q3UJD6 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Usp19Q3UJD6 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Usp19Q3UJD6 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Usp19Q3UJD6 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Usp19Q3UJD6 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Usp19Q3UJD6 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Usp19Q3UJD6 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Usp19Q3UJD6 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Usp19Q3UJD6 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Usp19Q3UJD6 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Usp19Q3UJD6 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Usp19Q3UJD6 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Usp19Q3UJD6 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Usp19Q3UJD6 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Usp19Q3UJD6 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Usp19Q3UJD6 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Usp19Q3UJD6 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Usp19Q3UJD6 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Usp19Q3UJD6 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Usp19Q3UJD6 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Usp19Q3UJD6 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Usp19Q3UJD6 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Usp19Q3UJD6 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Usp19Q3UJD6 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Usp19Q3UJD6 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Usp19Q3UJD6 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Usp19Q3UJD6 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Usp19Q3UJD6 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Usp19Q3UJD6 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Usp19Q3UJD6 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.8 ms