Protein–RNA interactions for Protein: Q3UHE1

Pitpnm3, Membrane-associated phosphatidylinositol transfer protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 974 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pitpnm3Q3UHE1 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pitpnm3Q3UHE1 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pitpnm3Q3UHE1 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pitpnm3Q3UHE1 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pitpnm3Q3UHE1 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pitpnm3Q3UHE1 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pitpnm3Q3UHE1 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pitpnm3Q3UHE1 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pitpnm3Q3UHE1 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pitpnm3Q3UHE1 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pitpnm3Q3UHE1 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pitpnm3Q3UHE1 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pitpnm3Q3UHE1 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pitpnm3Q3UHE1 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pitpnm3Q3UHE1 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pitpnm3Q3UHE1 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pitpnm3Q3UHE1 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pitpnm3Q3UHE1 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pitpnm3Q3UHE1 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pitpnm3Q3UHE1 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pitpnm3Q3UHE1 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pitpnm3Q3UHE1 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pitpnm3Q3UHE1 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pitpnm3Q3UHE1 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pitpnm3Q3UHE1 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pitpnm3Q3UHE1 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pitpnm3Q3UHE1 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pitpnm3Q3UHE1 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pitpnm3Q3UHE1 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pitpnm3Q3UHE1 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pitpnm3Q3UHE1 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pitpnm3Q3UHE1 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pitpnm3Q3UHE1 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pitpnm3Q3UHE1 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pitpnm3Q3UHE1 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pitpnm3Q3UHE1 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Pitpnm3Q3UHE1 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pitpnm3Q3UHE1 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pitpnm3Q3UHE1 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pitpnm3Q3UHE1 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pitpnm3Q3UHE1 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pitpnm3Q3UHE1 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pitpnm3Q3UHE1 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pitpnm3Q3UHE1 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pitpnm3Q3UHE1 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pitpnm3Q3UHE1 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pitpnm3Q3UHE1 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pitpnm3Q3UHE1 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pitpnm3Q3UHE1 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pitpnm3Q3UHE1 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pitpnm3Q3UHE1 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pitpnm3Q3UHE1 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pitpnm3Q3UHE1 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pitpnm3Q3UHE1 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pitpnm3Q3UHE1 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Pitpnm3Q3UHE1 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pitpnm3Q3UHE1 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pitpnm3Q3UHE1 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Pitpnm3Q3UHE1 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pitpnm3Q3UHE1 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pitpnm3Q3UHE1 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pitpnm3Q3UHE1 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pitpnm3Q3UHE1 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pitpnm3Q3UHE1 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pitpnm3Q3UHE1 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pitpnm3Q3UHE1 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pitpnm3Q3UHE1 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pitpnm3Q3UHE1 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pitpnm3Q3UHE1 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pitpnm3Q3UHE1 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pitpnm3Q3UHE1 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pitpnm3Q3UHE1 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pitpnm3Q3UHE1 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pitpnm3Q3UHE1 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pitpnm3Q3UHE1 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pitpnm3Q3UHE1 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pitpnm3Q3UHE1 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pitpnm3Q3UHE1 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pitpnm3Q3UHE1 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pitpnm3Q3UHE1 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pitpnm3Q3UHE1 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pitpnm3Q3UHE1 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pitpnm3Q3UHE1 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pitpnm3Q3UHE1 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pitpnm3Q3UHE1 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pitpnm3Q3UHE1 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pitpnm3Q3UHE1 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pitpnm3Q3UHE1 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pitpnm3Q3UHE1 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pitpnm3Q3UHE1 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pitpnm3Q3UHE1 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pitpnm3Q3UHE1 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pitpnm3Q3UHE1 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pitpnm3Q3UHE1 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pitpnm3Q3UHE1 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Pitpnm3Q3UHE1 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pitpnm3Q3UHE1 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Pitpnm3Q3UHE1 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pitpnm3Q3UHE1 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pitpnm3Q3UHE1 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 107.8 ms