Protein–RNA interactions for Protein: Q3UGP9

Lrrc58, Leucine-rich repeat-containing protein 58, mousemouse

Predictions only

Length 366 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc58Q3UGP9 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Lrrc58Q3UGP9 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Lrrc58Q3UGP9 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Lrrc58Q3UGP9 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Lrrc58Q3UGP9 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Lrrc58Q3UGP9 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Lrrc58Q3UGP9 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Lrrc58Q3UGP9 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Lrrc58Q3UGP9 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Lrrc58Q3UGP9 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Lrrc58Q3UGP9 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Lrrc58Q3UGP9 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Lrrc58Q3UGP9 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Lrrc58Q3UGP9 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Lrrc58Q3UGP9 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Lrrc58Q3UGP9 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
Lrrc58Q3UGP9 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Lrrc58Q3UGP9 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Lrrc58Q3UGP9 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lrrc58Q3UGP9 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lrrc58Q3UGP9 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lrrc58Q3UGP9 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lrrc58Q3UGP9 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lrrc58Q3UGP9 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lrrc58Q3UGP9 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lrrc58Q3UGP9 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lrrc58Q3UGP9 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Lrrc58Q3UGP9 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Lrrc58Q3UGP9 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lrrc58Q3UGP9 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lrrc58Q3UGP9 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lrrc58Q3UGP9 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lrrc58Q3UGP9 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lrrc58Q3UGP9 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lrrc58Q3UGP9 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Lrrc58Q3UGP9 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lrrc58Q3UGP9 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lrrc58Q3UGP9 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lrrc58Q3UGP9 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lrrc58Q3UGP9 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lrrc58Q3UGP9 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lrrc58Q3UGP9 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lrrc58Q3UGP9 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lrrc58Q3UGP9 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lrrc58Q3UGP9 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lrrc58Q3UGP9 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lrrc58Q3UGP9 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lrrc58Q3UGP9 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Lrrc58Q3UGP9 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lrrc58Q3UGP9 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Lrrc58Q3UGP9 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lrrc58Q3UGP9 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lrrc58Q3UGP9 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lrrc58Q3UGP9 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lrrc58Q3UGP9 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lrrc58Q3UGP9 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lrrc58Q3UGP9 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lrrc58Q3UGP9 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Lrrc58Q3UGP9 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lrrc58Q3UGP9 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lrrc58Q3UGP9 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lrrc58Q3UGP9 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lrrc58Q3UGP9 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lrrc58Q3UGP9 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lrrc58Q3UGP9 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lrrc58Q3UGP9 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lrrc58Q3UGP9 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lrrc58Q3UGP9 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lrrc58Q3UGP9 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lrrc58Q3UGP9 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lrrc58Q3UGP9 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lrrc58Q3UGP9 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lrrc58Q3UGP9 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lrrc58Q3UGP9 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lrrc58Q3UGP9 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lrrc58Q3UGP9 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lrrc58Q3UGP9 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lrrc58Q3UGP9 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lrrc58Q3UGP9 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lrrc58Q3UGP9 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lrrc58Q3UGP9 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lrrc58Q3UGP9 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lrrc58Q3UGP9 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lrrc58Q3UGP9 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lrrc58Q3UGP9 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lrrc58Q3UGP9 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lrrc58Q3UGP9 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lrrc58Q3UGP9 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lrrc58Q3UGP9 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lrrc58Q3UGP9 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lrrc58Q3UGP9 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lrrc58Q3UGP9 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lrrc58Q3UGP9 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lrrc58Q3UGP9 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lrrc58Q3UGP9 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lrrc58Q3UGP9 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lrrc58Q3UGP9 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Lrrc58Q3UGP9 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lrrc58Q3UGP9 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lrrc58Q3UGP9 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.8 ms