Protein–RNA interactions for Protein: Q3UEB3

Puf60, Poly(U)-binding-splicing factor PUF60, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 564 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Puf60Q3UEB3 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Puf60Q3UEB3 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Puf60Q3UEB3 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Puf60Q3UEB3 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Puf60Q3UEB3 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Puf60Q3UEB3 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Puf60Q3UEB3 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Puf60Q3UEB3 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Puf60Q3UEB3 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Puf60Q3UEB3 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Puf60Q3UEB3 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Puf60Q3UEB3 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Puf60Q3UEB3 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Puf60Q3UEB3 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Puf60Q3UEB3 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Puf60Q3UEB3 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Puf60Q3UEB3 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Puf60Q3UEB3 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Puf60Q3UEB3 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Puf60Q3UEB3 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Puf60Q3UEB3 Polr2i-202ENSMUST00000108192 508 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Puf60Q3UEB3 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Puf60Q3UEB3 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Puf60Q3UEB3 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Puf60Q3UEB3 Auts2-212ENSMUST00000178555 309 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Puf60Q3UEB3 AC155252.2-201ENSMUST00000226946 680 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Puf60Q3UEB3 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Puf60Q3UEB3 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Puf60Q3UEB3 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Puf60Q3UEB3 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Puf60Q3UEB3 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Puf60Q3UEB3 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Puf60Q3UEB3 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Puf60Q3UEB3 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Puf60Q3UEB3 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Puf60Q3UEB3 Gm14701-201ENSMUST00000117156 348 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Puf60Q3UEB3 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Puf60Q3UEB3 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Puf60Q3UEB3 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Puf60Q3UEB3 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Puf60Q3UEB3 Gm8396-201ENSMUST00000057361 823 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Puf60Q3UEB3 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Puf60Q3UEB3 A130006I12Rik-201ENSMUST00000091396 408 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Puf60Q3UEB3 Olfr615-201ENSMUST00000098198 942 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Puf60Q3UEB3 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Puf60Q3UEB3 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Puf60Q3UEB3 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Puf60Q3UEB3 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Puf60Q3UEB3 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Puf60Q3UEB3 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Puf60Q3UEB3 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Puf60Q3UEB3 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Puf60Q3UEB3 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Puf60Q3UEB3 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Puf60Q3UEB3 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Puf60Q3UEB3 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Puf60Q3UEB3 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Puf60Q3UEB3 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Puf60Q3UEB3 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Puf60Q3UEB3 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Puf60Q3UEB3 Gm45612-201ENSMUST00000211320 160 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Puf60Q3UEB3 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Puf60Q3UEB3 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Puf60Q3UEB3 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Puf60Q3UEB3 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Puf60Q3UEB3 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Puf60Q3UEB3 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Puf60Q3UEB3 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Puf60Q3UEB3 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Puf60Q3UEB3 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Puf60Q3UEB3 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Puf60Q3UEB3 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Puf60Q3UEB3 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Puf60Q3UEB3 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Puf60Q3UEB3 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Puf60Q3UEB3 Gm34397-203ENSMUST00000214991 630 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Puf60Q3UEB3 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Puf60Q3UEB3 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Puf60Q3UEB3 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Puf60Q3UEB3 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Puf60Q3UEB3 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Puf60Q3UEB3 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Puf60Q3UEB3 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Puf60Q3UEB3 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Puf60Q3UEB3 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Puf60Q3UEB3 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Puf60Q3UEB3 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Puf60Q3UEB3 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Puf60Q3UEB3 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Puf60Q3UEB3 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Puf60Q3UEB3 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Puf60Q3UEB3 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Puf60Q3UEB3 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Puf60Q3UEB3 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
Puf60Q3UEB3 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Puf60Q3UEB3 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Puf60Q3UEB3 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Puf60Q3UEB3 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Puf60Q3UEB3 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Puf60Q3UEB3 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
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