Protein–RNA interactions for Protein: Q3UDP0

Wdr41, WD repeat-containing protein 41, mousemouse

Predictions only

Length 460 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Wdr41Q3UDP0 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Wdr41Q3UDP0 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Wdr41Q3UDP0 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Wdr41Q3UDP0 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Wdr41Q3UDP0 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Wdr41Q3UDP0 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Wdr41Q3UDP0 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Wdr41Q3UDP0 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Wdr41Q3UDP0 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Wdr41Q3UDP0 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Wdr41Q3UDP0 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Wdr41Q3UDP0 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Wdr41Q3UDP0 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Wdr41Q3UDP0 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Wdr41Q3UDP0 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Wdr41Q3UDP0 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Wdr41Q3UDP0 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Wdr41Q3UDP0 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Wdr41Q3UDP0 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Wdr41Q3UDP0 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Wdr41Q3UDP0 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Wdr41Q3UDP0 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Wdr41Q3UDP0 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Wdr41Q3UDP0 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Wdr41Q3UDP0 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Wdr41Q3UDP0 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Wdr41Q3UDP0 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Wdr41Q3UDP0 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Wdr41Q3UDP0 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Wdr41Q3UDP0 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Wdr41Q3UDP0 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Wdr41Q3UDP0 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Wdr41Q3UDP0 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Wdr41Q3UDP0 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Wdr41Q3UDP0 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Wdr41Q3UDP0 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Wdr41Q3UDP0 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Wdr41Q3UDP0 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Wdr41Q3UDP0 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Wdr41Q3UDP0 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Wdr41Q3UDP0 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Wdr41Q3UDP0 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Wdr41Q3UDP0 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Wdr41Q3UDP0 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Wdr41Q3UDP0 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Wdr41Q3UDP0 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Wdr41Q3UDP0 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Wdr41Q3UDP0 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Wdr41Q3UDP0 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Wdr41Q3UDP0 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Wdr41Q3UDP0 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Wdr41Q3UDP0 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Wdr41Q3UDP0 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Wdr41Q3UDP0 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Wdr41Q3UDP0 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Wdr41Q3UDP0 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Wdr41Q3UDP0 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Wdr41Q3UDP0 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Wdr41Q3UDP0 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Wdr41Q3UDP0 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Wdr41Q3UDP0 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Wdr41Q3UDP0 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Wdr41Q3UDP0 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Wdr41Q3UDP0 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Wdr41Q3UDP0 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Wdr41Q3UDP0 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Wdr41Q3UDP0 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Wdr41Q3UDP0 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Wdr41Q3UDP0 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Wdr41Q3UDP0 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Wdr41Q3UDP0 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Wdr41Q3UDP0 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Wdr41Q3UDP0 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Wdr41Q3UDP0 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Wdr41Q3UDP0 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Wdr41Q3UDP0 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Wdr41Q3UDP0 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Wdr41Q3UDP0 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Wdr41Q3UDP0 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Wdr41Q3UDP0 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Wdr41Q3UDP0 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Wdr41Q3UDP0 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Wdr41Q3UDP0 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Wdr41Q3UDP0 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Wdr41Q3UDP0 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Wdr41Q3UDP0 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Wdr41Q3UDP0 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Wdr41Q3UDP0 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Wdr41Q3UDP0 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Wdr41Q3UDP0 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Wdr41Q3UDP0 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Wdr41Q3UDP0 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Wdr41Q3UDP0 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Wdr41Q3UDP0 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Wdr41Q3UDP0 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Wdr41Q3UDP0 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Wdr41Q3UDP0 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Wdr41Q3UDP0 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Wdr41Q3UDP0 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Wdr41Q3UDP0 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.2 ms