Protein–RNA interactions for Protein: Q3U7U4

Transmembrane protein C1orf162 homolog, mousemouse

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Length 132 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3U7U4 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q3U7U4 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q3U7U4 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q3U7U4 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q3U7U4 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q3U7U4 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q3U7U4 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q3U7U4 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q3U7U4 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q3U7U4 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q3U7U4 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q3U7U4 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q3U7U4 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q3U7U4 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q3U7U4 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q3U7U4 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q3U7U4 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q3U7U4 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q3U7U4 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q3U7U4 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q3U7U4 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q3U7U4 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q3U7U4 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q3U7U4 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q3U7U4 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q3U7U4 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q3U7U4 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q3U7U4 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q3U7U4 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q3U7U4 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q3U7U4 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q3U7U4 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q3U7U4 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q3U7U4 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q3U7U4 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Q3U7U4 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q3U7U4 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q3U7U4 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q3U7U4 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q3U7U4 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q3U7U4 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q3U7U4 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q3U7U4 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q3U7U4 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q3U7U4 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q3U7U4 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q3U7U4 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q3U7U4 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q3U7U4 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q3U7U4 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q3U7U4 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q3U7U4 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q3U7U4 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q3U7U4 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q3U7U4 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q3U7U4 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Q3U7U4 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q3U7U4 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q3U7U4 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q3U7U4 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q3U7U4 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q3U7U4 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q3U7U4 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q3U7U4 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q3U7U4 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q3U7U4 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q3U7U4 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q3U7U4 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q3U7U4 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q3U7U4 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q3U7U4 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q3U7U4 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q3U7U4 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Q3U7U4 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q3U7U4 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q3U7U4 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q3U7U4 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q3U7U4 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q3U7U4 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q3U7U4 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q3U7U4 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q3U7U4 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Q3U7U4 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.02
Q3U7U4 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Q3U7U4 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Q3U7U4 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Q3U7U4 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Q3U7U4 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Q3U7U4 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Q3U7U4 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Q3U7U4 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Q3U7U4 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Q3U7U4 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Q3U7U4 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Q3U7U4 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Q3U7U4 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Q3U7U4 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Q3U7U4 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Q3U7U4 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Q3U7U4 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.1 ms